Mapping genetic modulators of amyloid plaque deposition in TgCRND8 transgenic mice
Notice bibliographique
Résumé
Alzheimer's disease (AD) is a complex disorder for which various in vivo models exist. The TgCRND8 mouse, transgenic for the human amyloid precursor protein, is an aggressive early onset model of brain amyloid deposition. Preliminary studies revealed that when the transgene is expressed on an A/J genetic background, these mice not only survive longer but also deposit less parenchymal amyloid-beta (Abeta) peptides as compared to those on a C57BL/6 background. We performed a genome-wide study of an F2 intercross between TgCRND8 on an A/J background and C57BL/6 mice, to identify genetic modulators of amyloid accumulation and deposition. We identified four highly significant QTLs that together account for 55% of the phenotypic variance in the number of plaques (Thioflavin S). QTLs were found on the distal part of chromosome 4 with an LOD score of 8.1 at D4Mit251, on chromosome 11 with an LOD score of 5.5 at D11Mit242, on chromosome 9 with an LOD score of 5.0 at D9Mit336 and on the proximal part of chromosome 8 with an LOD score of 4.5 at D8Mit223. A/J alleles at these loci are protective and all decreased the amount of Abeta deposition. Interestingly, the QTL on chromosome 11 is also significantly linked to the levels of brain Abeta(42) and Abeta(40). Although these QTLs do not control the levels of plasmatic Abeta, other regions on chromosomes 1 and 6 show significant linkage. Further characterization of these QTL regions may lead to the identification of genes involved in the pathogenesis of AD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».