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Enregistrement W2168445252 · doi:10.1186/2049-3002-1-9

p53 promotes the expression of gluconeogenesis-related genes and enhances hepatic glucose production

2013· article· en· W2168445252 sur OpenAlex
Ido Goldstein, Keren Yizhak, Shalom Madar, Naomi Goldfinger, Eytan Ruppin, Varda Rotter

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCancer & Metabolism · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAzrieli FoundationWeizmann Institute of ScienceFlight Attendant Medical Research Institute
Mots-clésGluconeogenesisGlycolysisPentose phosphate pathwayTranscriptomeMetabolic pathwayCarcinogenesisBiologyTranscription factorBiochemistryCitric acid cyclePhosphoenolpyruvate carboxykinaseCell biologyGene expressionChemistryGeneMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The p53 tumor suppressor protein is a transcription factor that initiates transcriptional programs aimed at inhibiting carcinogenesis. p53 represses metabolic pathways that support tumor development (such as glycolysis and the pentose phosphate pathway (PPP)) and enhances metabolic pathways that are considered counter-tumorigenic such as fatty acid oxidation. FINDINGS: In an attempt to comprehensively define metabolic pathways regulated by p53, we performed two consecutive high-throughput analyses in human liver-derived cells with varying p53 statuses. A gene expression microarray screen followed by constraint-based modeling (CBM) predicting metabolic changes imposed by the transcriptomic changes suggested a role for p53 in enhancing gluconeogenesis (de novo synthesis of glucose). Examining glucogenic gene expression revealed a p53-dependent induction of genes involved in both gluconeogenesis (G6PC, PCK2) and in supplying glucogenic precursors (glycerol kinase (GK), aquaporin 3 (AQP3), aquaporin 9 (AQP9) and glutamic-oxaloacetic transaminase 1 (GOT1)). Accordingly, p53 augmented hepatic glucose production (HGP) in both human liver cells and primary mouse hepatocytes. CONCLUSIONS: These findings portray p53 as a novel regulator of glucose production. By facilitating glucose export, p53 may prevent it from being shunted to pro-cancerous pathways such as glycolysis and the PPP. Thus, our findings suggest a metabolic pathway through which p53 may inhibit tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,166
Score d'incertitude au seuil0,623

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle