MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168634761 · doi:10.1158/0008-5472.can-09-1778

Loss of Collapsin Response Mediator Protein1, as Detected by iTRAQ Analysis, Promotes Invasion of Human Gliomas Expressing Mutant EGFRvIII

2009· article· en· W2168634761 sur OpenAlexaff
Joydeep Mukherjee, Leroi V. DeSouza, Johann Micallef, Zia Karim, Sidney Croul, K. W. Michael Siu, Abhijit Guha

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenToronto Western HospitalYork UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene knockdownMutantWestern blotCancer researchCell cultureBiologyPhenotypeMolecular biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common and lethal primary human brain tumor. GBMs are characterized by a variety of genetic alterations, among which oncogenic mutations of epidermal growth factor receptor (EGFRvIII) is most common. GBMs harboring EGFRvIII have increased proliferation and invasive characteristics versus those expressing wild-type (wt) EGFR. To identify the molecular basis of this increased tumorgenic phenotype, we used iTRAQ-labeling differential proteomic analysis. Among several differentially expressed proteins, we selected CRMP1, a protein implicated in cellular invasion that was markedly decreased in GBMs expressing EGFRvIII, for further study. The differential expression of CRMP1 was confirmed in a panel of human GBM cell lines and operative specimens that express wtEGFR or mutant EGFRvIII by quantitative real-time PCR, Western blot, and immunohistochemical analysis. In human GBM samples, decreased expression of CRMP1 correlated with EGFRvIII positivity. Knockdown of CRMP1 by siRNA resulted in increased invasion of wtEGFR expressing human GBM cells (U87 and U373) to those found in isogenic GBM cells. Exogenous expression of EGFRvIII in these wtEGFR-expressing GBM cells promoted their ability to invade and was accompanied by decreased expression of CRMP1. Rescuing CRMP1 expression decreased invasion of the EGFRvIII-expressing GBM cells by tilting the balance between Rac and Rho. Collectively, these results show that the loss of CRMP1 contribute to the increased invasive phenotype of human GBMs expressing mutant EGFRvIII.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,681

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,089
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetAxon Guidance and Neuronal SignalingTravaux en français237 207