Shikimate leaf disc assay for early detection of glyphosate resistance in <i>Conyza canadensis</i> and relative transcript levels of EPSPS and ABC transporter genes
Notice bibliographique
Résumé
N ol N, T sikou D, E id M, L ivieratos IC & G iannopolitis CN (2012). Shikimate leaf disc assay for early detection of glyphosate resistance in Conyza canadensis and relative transcript levels of EPSPS and ABC transporter genes. Weed Research 52 , 233–241. Summary Twenty‐two biotypes of Conyza canadensis (Canadian fleabane, horseweed) from a conventional orchard in Crete displayed varying degrees of reduced glyphosate susceptibility in standard whole plant assays. A refined shikimate leaf disc assay was developed to precisely determine the resistance levels, permitting early detection of resistance evolution and integrated management of the weed. The 5‐enolpyruvoylshikimate‐3‐phosphate synthase (EPSPS) homologue genes (1 and 2) were sequenced for three different biotypes (one of reduced susceptibility from Crete, one resistant from mainland Greece and one resistant from the USA), and no amino acid substitution of Pro106 was found. Real‐time qRT‐PCR was used to study the expression profiles for EPSPS and the M10 and M11 ABC transporter genes, following glyphosate application. The expression levels of the EPSPS genes were not significantly altered following glyphosate application in any biotype, but both M10 and M11 were found to be highly upregulated in glyphosate‐treated reduced susceptibility or resistant biotypes and not in a susceptible biotype. These results are in accordance with data recently reported by other researchers, supporting a role of the M10 and M11 ABC transporter genes in glyphosate resistance in Conyza canadensis , because of reduced translocation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».