MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2168799765 · doi:10.1126/science.1112680

The Genome of the Kinetoplastid Parasite, <i>Leishmania major</i>

2005· article· en· W2168799765 sur OpenAlexaff
Alasdair Ivens, Christopher S. Peacock, Elizabeth A. Worthey, Lee Murphy, Gautam Aggarwal, Matthew Berriman, Ellen Sisk, Marie‐Adèle Rajandream, Ellen Adlem, Rita Aert, Atashi Anupama, Zina Apostolou, Philip Attipoe, Nathalie Bason, Christopher Bauser, Alfred Beck, Stephen M. Beverley, Gabriella Bianchettin, Katja Borzym, Gordana Bothe, Carlo V. Bruschi, Matt Collins, Eithon Cadag, Laura Ciarloni, Christine Clayton, Richard Coulson, Ann Cronin, Ângela K. Cruz, Robert M. Davies, Javier De Gaudenzi, Deborah E. Dobson, Andreas Duesterhoeft, Gholam Fazelina, Nigel Fosker, Alberto C.C. Frasch, Audrey Fraser, Monika Fuchs, Claudia Gabel, Arlette Goble, André Goffeau, David Harris, Christiane Hertz‐Fowler, H. Hilbert, David Horn, Yiting Huang, Sven Klages, Andrew Knights, Michael Kube, Natasha Larke, Lyudmila Litvin, Angela Lord, Tin Louie, Marco A. Marra, David Masuy, Keith R. Matthews, Shulamit Michaeli, Jeremy C. Mottram, Silke Müller-Auer, Heather Munden, Halina Norbertczak, Karen Oliver, Susan O’Neil, Martin Pentony, Thomas Pohl, Claire Price, Bénédicte Purnelle, Michael A. Quail, Ester Rabbinowitsch, Richard Reinhardt, Michael A. Rieger, Joel Rinta, Johan Robben, Laura Robertson, Jerônimo C. Ruiz, Simon Rutter, David Saunders, Melanie Schäfer, Jacquie Schein, David C. Schwartz, Kathy Seeger, Amber Seyler, Sarah Sharp, Heesun Shin, Dhileep Sivam, Rob Squares, Steve Squares, Valentina Tosato, Christy Vogt, Guido Volckaert, R. Wambutt, Tim Warren, Holger Wedler, John R. Woodward, Shiguo Zhou, Wolfgang Zimmermann, Deborah F. Smith, Jenefer M. Blackwell, Kenneth Stuart, Bart Barrell, Peter J. Myler

Notice bibliographique

RevueScience · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreGenome British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesWellcome Trust
Mots-clésBiologyGenePseudogeneGenomeGeneticsRNATranscription (linguistics)RNA polymerase IIRNA polymeraseTrypanosoma bruceiLeishmaniaGene expressionParasite hostingPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leishmania species cause a spectrum of human diseases in tropical and subtropical regions of the world. We have sequenced the 36 chromosomes of the 32.8-megabase haploid genome of Leishmania major (Friedlin strain) and predict 911 RNA genes, 39 pseudogenes, and 8272 protein-coding genes, of which 36% can be ascribed a putative function. These include genes involved in host-pathogen interactions, such as proteolytic enzymes, and extensive machinery for synthesis of complex surface glycoconjugates. The organization of protein-coding genes into long, strand-specific, polycistronic clusters and lack of general transcription factors in the L. major, Trypanosoma brucei, and Trypanosoma cruzi (Tritryp) genomes suggest that the mechanisms regulating RNA polymerase II-directed transcription are distinct from those operating in other eukaryotes, although the trypanosomatids appear capable of chromatin remodeling. Abundant RNA-binding proteins are encoded in the Tritryp genomes, consistent with active posttranscriptional regulation of gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 362
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScienceMême sujetResearch on Leishmaniasis StudiesTravaux en français237 207