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Enregistrement W2169557347 · doi:10.1074/jbc.m010441200

Interaction of 11-cis-Retinol Dehydrogenase with the Chromophore of Retinal G Protein-coupled Receptor Opsin

2001· article· en· W2169557347 sur OpenAlexaboutno aff
Pu Chen, Terry D. Lee, HenryK.W. Fong

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Cancer InstituteNational Eye Institute
Mots-clésOpsinRetinalRetinaldehydeBiologyPhotoisomerizationRhodopsinRetinal pigment epitheliumVisual phototransductionBiochemistryChemistryIsomerization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vertebrate opsins in both photoreceptors and the retinal pigment epithelium (RPE) have fundamental roles in the visual process. The visual pigments in photoreceptors are bound to 11-cis-retinal and are responsible for the initiation of visual excitation. Retinochrome-like opsins in the RPE are bound to all-trans-retinal and play an important role in chromophore metabolism. The retinal G protein-coupled receptor (RGR) of the RPE and Müller cells is an abundant opsin that generates 11-cis-retinal by stereospecific photoisomerization of its bound all-trans-retinal chromophore. We have analyzed a 32-kDa protein (p32) that co-purifies with bovine RGR from RPE microsomes. The co-purified p32 was identified by mass spectrometric analysis as 11-cis-retinol dehydrogenase (cRDH), and enzymatic assays have confirmed the isolation of an active cRDH. The co-purified cRDH showed marked substrate preference to 11-cis-retinal and preferred NADH rather than NADPH as the cofactor in reduction reactions. cRDH did not react with endogenous all-trans-retinal bound to RGR but reacted specifically with 11-cis-retinal that was generated by photoisomerization after irradiation of RGR. The reduction of 11-cis-retinal to 11-cis-retinol by cRDH enhanced the net photoisomerization of all-trans-retinal bound to RGR. These results indicate that cRDH is involved in the processing of 11-cis-retinal after irradiation of RGR opsin and suggest that cRDH has a novel role in the visual cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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