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Enregistrement W2170257753 · doi:10.1093/toxsci/kfp160

Effects of 18 Perfluoroalkyl Compounds on mRNA Expression in Chicken Embryo Hepatocyte Cultures

2009· article· en· W2170257753 sur OpenAlexaff
Nathan J. Hickey, Doug Crump, Stephanie P. Jones, Sean W. Kennedy

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePer- and polyfluoroalkyl substances research
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPerfluorooctaneChemistryMessenger RNACytochrome P450BiochemistryHepatocyteLipid metabolismMetabolismBiologyGeneSulfonateSodiumIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many studies have characterized the effects of perfluoroalkyl compounds (PFCs) in mammalian species, but limited information exists on the effects of PFCs in birds. PFCs have been detected in serum and liver of avian wildlife worldwide. While the molecular mechanisms have yet to be elucidated in detail, PFCs alter lipid metabolism through peroxisome proliferation, xenobiotic metabolism by activating the cytochrome P450 (CYP) system, and serum cholesterol levels by inducing or repressing key genes. Here, we employed a simple messenger RNA (mRNA) screening method using quantitative PCR to assess the effects of PFCs on mRNA expression in chicken embryo hepatocytes (CEH). CEH cultures were treated with perfluoroalkyl sulfonates and perfluoroalkyl carboxylates of varying chain lengths and linear or technical grade potassium perfluoro-1-octane sulfonate (L-PFOS and T-PFOS). T-PFOS comprised 80% perfluorooctane sulfonate isomers (62% linear) and various PFCs and inorganic salts. Relative mRNA expression levels of the following genes were examined: acyl-CoA oxidase (ACOX), liver fatty acid-binding protein (L-FABP), CYP1A4/1A5 and CYP4B1, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A (HMG-CoA) reductase, and sterol regulatory element-binding protein 2 (SREBP2). Compared to L-PFOS, T-PFOS altered the mRNA expression level of more genes and produced greater fold changes. L-FABP was upregulated by PFCs greater than or equal to eight carbons, while CYPs were upregulated by PFCs less than or equal to eight carbons. ACOX, HMG-CoA, and SREBP2 showed little to no change following PFC exposure. This study is the first to expose CEH cultures to multiple PFCs in vitro and demonstrates that exposure to PFC solutions of different isomeric content or chain length causes variable transcriptional responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,675
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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