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Enregistrement W2170689018 · doi:10.1111/cge.12311

A recurrent mutation in <i><scp>DEPDC5</scp></i> predisposes to focal epilepsies in the French‐Canadian population

2013· article· en· W2170689018 sur OpenAlexafffundabout
Caroline P. Martin, Catherine Meloche, Marie France Rioux, Dang Khoa Nguyen, Lionel Carmant, E. Andermann, Micheline Gravel, Patrick Cossette

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéGenome Canada
Mots-clésEpilepsyMutationGenotypingPopulationGeneticsEpilepsy syndromesAlleleAllele frequencyBiologyBioinformaticsMedicineGeneNeuroscienceGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Familial focal epilepsy with variable foci (FFEVF) is a heterogeneous epilepsy syndrome originally described in the French-Canadian (FC) population. Mutations in DEPDC5 have recently been identified in multiple cases of FFEVF as well as in a wide spectrum of other familial focal epilepsies. In this study, we aimed to determine the frequency of mutation of this gene in our large cohort of FC individuals with FFEVF, as well as familial and sporadic cases with focal epilepsy. We report a recurrent p.R843X protein-truncating mutation segregating in one large FFEVF and two small focal epilepsy FC families. Fine genotyping suggests an ancestral allele. A new p.T864M variant, predicted to be disease-causing, was also identified in a small FC family. Overall, we identified DEPDC5 mutations in 5% of our familial and sporadic focal epilepsy cases (4/79). Our results support the view that mutations in the DEPDC5 gene are an important cause of autosomal dominant focal epilepsies in the FC population, including a founder mutation that is specific to this population. These findings may facilitate molecular diagnosis in clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,569
Score d'incertitude au seuil0,857

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,378
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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