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Enregistrement W2170698118 · doi:10.1093/cid/cis737

Outbreak of Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Containing blaNDM-1, Ontario, Canada

2012· article· en· W2170698118 sur OpenAlexaffabout
Sergio Borgia, Olga Lastovetska, Denyse Richardson, Alireza Eshaghi, Ji Xiong, Catherine Chung, M. Baqi, Allison McGeer, Giovanni Ricci, Rachael Sawicki, Rajni Pantelidis, Donald E. Low, Samir N. Patel, Roberto G. Melano

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensMcMaster UniversityPublic Health OntarioUniversity of TorontoToronto Public HealthWilliam Osler Health System
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKlebsiella pneumoniaeOutbreakEnterobacteriaceaeMicrobiologyTypingPlasmidCarbapenem-resistant enterobacteriaceaeIsolation (microbiology)MedicineInfection controlMultilocus sequence typingEscherichia coliVirologyBiologyGenotypeIntensive care medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: New Delhi metallo-ß-lactamase (NDM) has emerged worldwide in clinically relevant gram-negative bacteria. We report an outbreak of NDM-producing Klebsiella pneumoniae in patients with no prior travel history to endemic regions. METHODS: Five NDM-1-producing K. pneumoniae colonizing and/or clinically infecting patients in a community tertiary hospital were detected between October and November 2011. NDM-1-producing Enterobacteriaceae (K. pneumoniae and Escherichia coli) were clinically and epidemiologically characterized, including susceptibility profiles, molecular typing, and molecular characterization of plasmids and resistant determinants. RESULTS: Five patients were identified carrying NDM-1-producing K. pneumoniae, all of them epidemiologically linked with each other. K. pneumoniae were confirmed to belong to the same clone, exhibiting multidrug-resistant phenotypes. One patient was positive for NDM-1-producing E. coli in blood and E. coli and K. pneumoniae in rectal specimens, both containing the same bla(NDM) plasmid, suggesting horizontal transfer between species in the patient. No environmental sources of these strains were found. Detection of positive isolates directly from rectal specimens allowed the rapid identification and isolation of colonized patients. CONCLUSIONS: We report a NDM-1-producing K. pneumoniae outbreak in Ontario, Canada. Implementation of standard infection control practices, including active screening was able to contain the spread of this organism in the hospital setting. Of concern is the potential loss of a travel history to identify patients that are at high risk of being colonized or infected with this organism and the lack of an accurate, cost-effective test that can be implemented in the hospital setting to identify these multidrug-resistant organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,602
Score d'incertitude au seuil0,803

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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