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Enregistrement W2170791918 · doi:10.1038/nbt.1546

Multi-site assessment of the precision and reproducibility of multiple reaction monitoring–based measurements of proteins in plasma

2009· article· en· W2170791918 sur OpenAlexaff
Terri A. Addona, Susan E. Abbatiello, Birgit Schilling, Steven J. Skates, D.R. Mani, David M. Bunk, Clifford H. Spiegelman, Lisa J. Zimmerman, Amy‐Joan L. Ham, Hasmik Keshishian, Steven C. Hall, Simon Allen, Ronald K. Blackman, Christoph H. Borchers, Charles R. Buck, Helene L. Cardasis, Michael P. Cusack, Nathan G. Dodder, Bradford W. Gibson, Jason M. Held, Tara Hiltke, Angela Jackson, Eric Johansen, Christopher R. Kinsinger, Jing Li, Mehdi Mesri, Thomas A. Neubert, Richard K. Niles, Trenton C. Pulsipher, David F. Ransohoff, Henry Rodriguez, Paul A. Rudnick, Derek Smith, David L. Tabb, Tony Tegeler, Asokan Mulayath Variyath, Lorenzo J. Vega-Montoto, Åsa Wåhlander, Sofia Waldemarson, Mu Wang, Jeffrey R. Whiteaker, Lei Zhao, N. Leigh Anderson, Susan J. Fisher, D.C. Liebler, Amanda G. Paulovich, Fred E. Regnier, Paul Tempst, Steven A. Carr

Notice bibliographique

RevueNature Biotechnology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteUniversity of California, San FranciscoU.S. Public Health ServiceCanary Foundation
Mots-clésReproducibilitySelected reaction monitoringTransferabilityBiomarker discoveryBiomarkerMass spectrometryChemistryChromatographyComputational biologyComputer scienceTandem mass spectrometryProteomicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,988
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 037
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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