The complete plastid genome sequence of the parasitic green alga Helicosporidium sp. is highly reduced and structured
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Loss of photosynthesis has occurred independently in several plant and algal lineages, and represents a major metabolic shift with potential consequences for the content and structure of plastid genomes. To investigate such changes, we sequenced the complete plastid genome of the parasitic, non-photosynthetic green alga, Helicosporidium. RESULTS: The Helicosporidium plastid genome is among the smallest known (37.5 kb), and like other plastids from non-photosynthetic organisms it lacks all genes for proteins that function in photosynthesis. Its reduced size results from more than just loss of genes, however; it has little non-coding DNA, with only one intron and tiny intergenic spaces, and no inverted repeat (no duplicated genes at all). It encodes precisely the minimal complement of tRNAs needed to translate the universal genetic code, and has eliminated all redundant isoacceptors. The Helicosporidium plastid genome is also highly structured, with each half of the circular genome containing nearly all genes on one strand. Helicosporidium is known to be related to trebouxiophyte green algae, but the genome is structured and compacted in a manner more reminiscent of the non-photosynthetic plastids of apicomplexan parasites. CONCLUSION: Helicosporidium contributes significantly to our understanding of the evolution of plastid DNA because it illustrates the highly ordered reduction that occurred following the loss of a major metabolic function. The convergence of plastid genome structure in Helicosporidium and the Apicomplexa raises the interesting possibility that there are common forces that shape plastid genomes, subsequent to the loss of photosynthesis in an organism.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».