MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2171633208 · doi:10.1099/ijs.0.65690-0

Marinobacter psychrophilus sp. nov., a psychrophilic bacterium isolated from the Arctic

2008· article· en· W2171633208 sur OpenAlexaboutno aff
Dahai Zhang, H.-R. Li, Xin Yi, Zhe Chi, Ping Zhou, Yan Yu

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyPsychrophile16S ribosomal RNAPhylogenetic treeBacteriaStrain (injury)genomic DNAMicrobiologyRibosomal RNAGeneGeneticsAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Strain 20041(T) was isolated from sea-ice of the Canadian Basin (7 degrees 23' 14'' N 14 degrees 06' 55'' W). Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene homology showed that strain 20041(T) was related to members of the genus Marinobacter and had highest 16S rRNA gene sequence similarity with the type strain of Marinobacter maritimus. Cells were Gram-negative, rod-shaped, psychrophilic and motile. The temperature range for growth was 0-22 degrees C, with optimum growth occurring at 16-18 degrees C and at approximately pH 6.0-9.0. Strain 20041(T) had ubiquinone-9 as the major respiratory quinone and iso-C(15 : 0) 2OH and/or C(16 : 1)omega7c, C(16 : 0), C(18 : 1)omega9c and C(12 : 0) 3OH as major fatty acids. The genomic DNA G+C content was 55.4 mol%. On the basis of the phenotypic characteristics, phylogenetic analysis and DNA-DNA relatedness data, strain 20041(T) is considered to represent a novel species, for which the name Marinobacter psychrophilus sp. nov. is proposed. The type strain is 20041(T) (=CGMCC 1.6499(T)=JCM 14643(T)).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,928
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGYMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207