MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2171686328

Model Systems to Explore CPB2 Pre-mRNA Splicing

2014· article· en· W2171686328 sur OpenAlexaff
Christina Marisa Rizzo

Notice bibliographique

RevueScholarship at UWindsor (University of Windsor) · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNA splicingMessenger RNAChemistryComputational biologyComputer scienceBiologyGeneticsGeneRNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thrombin Activatable Fibrinolysis Inhibitor (TAFI), encoded by CPB2, cleaves carboxyl-terminal lysine residues from partially degraded fibrin, thus assisting in the attenuation of fibrinolysis. The finding of several new alternatively spliced (AS) CPB2 variants within numerous cell types suggests that AS is an important mechanism regulating CPB2 gene expression. This thesis investigated the extent of AS events occurring in various vascular and immune cells, and identified proteins translated from AS CPB2 mRNA. To determine whether a minigene approach could be used to model the cell-specific AS pattern that occurs endogenously, two minigene constructs were created. Real time RT-PCR analysis revealed that the pattern and extent of AS varies in a cell-specific manner. However, the minigenes were found to be unable to recapitulate the cell-specific splicing pattern of CPB2 that occurs endogenously. Metabolic labeling in conjunction with immunoprecipitation resulted in the detection of the Delta7 TAFI variant retained within HepG2 cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,395
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScholarship at UWindsor (University of Windsor)Même sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207