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Enregistrement W2172003470 · doi:10.1128/jvi.01843-09

Inactivation of <i>Burkholderia cepacia</i> Complex Phage KS9 gp41 Identifies the Phage Repressor and Generates Lytic Virions

2009· article· en· W2172003470 sur OpenAlexafffund
Karlene H. Lynch, Kimberley D. Seed, Paul Stothard, Jonathan J. Dennis

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLytic cycleBiologyProphageLysogenic cycleMicrobiologyBurkholderia cenocepaciaTemperatenessSiphoviridaeBacteriophageBurkholderia cepacia complexLysogenBurkholderiaVirologyPhage therapyGeneGeneticsBacteriaVirusEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Burkholderia cepacia complex (BCC) is made up of at least 17 species of gram-negative opportunistic bacterial pathogens that cause fatal infections in patients with cystic fibrosis and chronic granulomatous disease. KS9 (vB_BcenS_KS9), one of a number of temperate phages isolated from BCC species, is a prophage of Burkholderia pyrrocinia LMG 21824. Transmission electron micrographs indicate that KS9 belongs to the family Siphoviridae and exhibits the B1 morphotype. The 39,896-bp KS9 genome, comprised of 50 predicted genes, integrates into the 3' end of the LMG 21824 GTP cyclohydrolase II open reading frame. The KS9 genome is most similar to uncharacterized prophage elements in the genome of B. cenocepacia PC184 (vB_BcenZ_ PC184), as well as Burkholderia thailandensis phage phiE125 and Burkholderia pseudomallei phage phi1026b. Using molecular techniques, we have disrupted KS9 gene 41, which exhibits similarity to genes encoding phage repressors, producing a lytic mutant named KS9c. This phage is incapable of stable lysogeny in either LMG 21824 or B. cenocepacia strain K56-2 and rescues a Galleria mellonella infection model from experimental B. cenocepacia K56-2 infections at relatively low multiplicities of infection. These results readily demonstrate that temperate phages can be genetically engineered to lytic form and that these modified phages can be used to treat bacterial infections in vivo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,545
Score d'incertitude au seuil0,914

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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