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Molecular phylogenetic evidence for multiple dispersal events in gomphocerine grasshoppers

2006· article· en· W2174203064 sur OpenAlexaff
Daniel Contreras, W. Chapco

Notice bibliographique

RevueJournal of Orthoptera Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueOrthoptera Research and Taxonomy
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesRussian Academy of SciencesAkdeniz ÜniversitesiCentre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le DéveloppementUniversidad de GranadaAcademia SinicaUniversity of WyomingUniversity of Florida
Mots-clésBiologyMonophylyBiological dispersalPhylogenetic treeSubfamilyMaximum parsimonyEvolutionary biologyParaphylyZoologyCladeGeneticsGenePopulationDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gomphocerine grasshoppers, comprising over 1000 species, occur on all continents excepting Australia and Madagascar. This work provides an independent examination of previous accounts of their taxonomic relationships and intercontinental connections, focusing on selected North American and Eurasian taxa. Our study is based on portions of four mitochondrial genes (coding for cytochrome b, cytochrome oxidase subunits I and II, and NADH dehydrogenase subunit V) which were sequenced and phylogenetically analyzed using weighted and unweighted maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian methods. Maximum resolution was achieved using weighted parsimony (counting transversions at third codon positions only) and Bayesian methods, and treating all four sequences, totalling 1892 bp, as a unit. The subfamily is provisionally accepted as monophyletic. The tribe Chrysochraontini is monophyletic, whereas the monophyletic status of Aulocarini and Dociostaurini is unclear. Tribes, Arcypterini, Chorthippini and Gomphocerini, are not monophyletic and require further scrutiny. Regarding biogeographic origins of the subfamily, our molecular data generally support Vickery's assertion that there were multiple periods of dispersal, most likely from Eurasia to North America. Assigning the range 50 to 70 Mya to the time of gomphocerine divergence, we provide estimates of the times of these biogeographic events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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