MTHFSD and DDX58 are novel RNA-binding proteins abnormally regulated in amyotrophic lateral sclerosis
Notice bibliographique
Résumé
Tar DNA-binding protein 43 (TDP-43) is an RNA-binding protein normally localized to the nucleus of cells, where it elicits functions related to RNA metabolism such as transcriptional regulation and alternative splicing. In amyotrophic lateral sclerosis, TDP-43 is mislocalized from the nucleus to the cytoplasm of diseased motor neurons, forming ubiquitinated inclusions. Although mutations in the gene encoding TDP-43, TARDBP, are found in amyotrophic lateral sclerosis, these are rare. However, TDP-43 pathology is common to over 95% of amyotrophic lateral sclerosis cases, suggesting that abnormalities of TDP-43 play an active role in disease pathogenesis. It is our hypothesis that a loss of TDP-43 from the nucleus of affected motor neurons in amyotrophic lateral sclerosis will lead to changes in RNA processing and expression. Identifying these changes could uncover molecular pathways that underpin motor neuron degeneration. Here we have used translating ribosome affinity purification coupled with microarray analysis to identify the mRNAs being actively translated in motor neurons of mutant TDP-43(A315T) mice compared to age-matched non-transgenic littermates. No significant changes were found at 5 months (presymptomatic) of age, but at 10 months (symptomatic) the translational profile revealed significant changes in genes involved in RNA metabolic process, immune response and cell cycle regulation. Of 28 differentially expressed genes, seven had a ≥ 2-fold change; four were validated by immunofluorescence labelling of motor neurons in TDP-43(A315T) mice, and two of these were confirmed by immunohistochemistry in amyotrophic lateral sclerosis cases. Both of these identified genes, DDX58 and MTHFSD, are RNA-binding proteins, and we show that TDP-43 binds to their respective mRNAs and we identify MTHFSD as a novel component of stress granules. This discovery-based approach has for the first time revealed translational changes in motor neurons of a TDP-43 mouse model, identifying DDX58 and MTHFSD as two TDP-43 targets that are misregulated in amyotrophic lateral sclerosis.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».