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Enregistrement W2175693398 · doi:10.1073/pnas.1506226112

Genome of <i>Rhodnius prolixus</i> , an insect vector of Chagas disease, reveals unique adaptations to hematophagy and parasite infection

2015· article· en· W2175693398 sur OpenAlex
Rafael D. Mesquita, Raquel J. Vionette-Amaral, Carl Lowenberger, Rolando Rivera‐Pomar, Fernando A. Monteiro, Patrick Minx, John Spieth, Antonio Bernardo Carvalho, Francisco Panzera, Daniel Lawson, André Torres, José M. C. Ribeiro, Marcos Henrique Ferreira Sorgine, Robert M. Waterhouse, Michael J. Montague, Fernando Abad‐Franch, Michele Alves‐Bezerra, Laurence Rodrigues do Amaral, Helena Araujo, Ricardo N. Araújo, L. Aravind, Geórgia C. Atella, Patrı́cia Azambuja, Mateus Berni, Paula Bittencourt‐Cunha, Glória Regina Cardoso Braz, Gustavo M. Calderón‐Fernández, Cláudia M. A. Carareto, Mikkel Christensen, Igor Costa, Samara Costa, Marílvia Dansa, Carlos R. O. Daumas-Filho, Iron F. De-Paula, Felipe A. Dias, George Dimopoulos, Scott Emrich, Natalia Esponda-Behrens, Patrı́cia Fampa, Rita D Fernández-Medina, Rodrigo Nunes da Fonseca, Marcio Fontenele, Catrina C. Fronick, Lucinda A. Fulton, Ana Caroline P. Gandara, Elói S. Garcia, Fernando Ariel Genta, Gloria I. Giraldo-Calderón, Bruno Gomes, Kátia C. Gondim, Adriana Granzotto, Alessandra A. Guarneri, Roderic Guigó, Myriam Harry, Daniel S. T. Hughes, Willy Jablonka, Emmanuelle Jacquin‐Joly, M. Patricia Juárez, Leonardo Barbosa Koerich, Angela B. Lange, José Manuel Latorre-Estivalis, Andrés Lavore, Gena G. Lawrence, Cristiano Lazoski, Cláudio R. Lazzari, Raphael R.S. Lopes, Marcelo Gustavo Lorenzo, Magda Delorence Lugon, David Majerowicz, Paula L. Marcet, Marco Mariotti, Hatisaburo Masuda, Karyn Mégy, Ana Claudia A. Melo, Fanis Missirlis, Theo Mota, Fernando G. Noriega, Marcela Nouzová, Rodrigo Dutra Nunes, Raquel L. L. Oliveira, Gilbert O. Silveira, Sheila Ons, Ian Orchard, Lucía Pagola, Gabriela O. Paiva‐Silva, Agustina Pascual, Márcio G. Pavan, Nicolás Pedríni, Alexandre A. Peixoto, Marcos H. Pereira, Andrew Pike, Carla Polycarpo, Francisco Prosdocimi, Rodrigo Ribeiro‐Rodrigues, Hugh M. Robertson, Ana Paula Salerno, Didier Salmon, Didac Santesmasses, Renata Schama, Eloy S. Seabra-Junior, Lívia Silva-Cardoso, Mário A.C. Silva-Neto, Matheus de Souza Gomes, Marcos Sterkel, Mabel L. Taracena, Marta Tojo, Zhijian Tu, José M. C. Tubío, Raùl Ursic-Bedoya, Thiago M. Venâncio, Ana Beatriz Walter‐Nuno, Derek A. Wilson, Wesley C. Warren, Richard K. Wilson, Erwin Huebner, Ellen M. Dotson, Pedro L. Oliveira

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of TorontoSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Human Genome Research InstituteU.S. Public Health ServiceNational Institutes of HealthFundación Bunge y BornFundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y TécnicasCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésRhodnius prolixusChagas diseaseRhodniusBiologyInsectVector (molecular biology)Parasite hostingVirologyGenomeZoologyTriatominaeGeneticsGeneHemipteraEcologyReduviidae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhodnius prolixus not only has served as a model organism for the study of insect physiology, but also is a major vector of Chagas disease, an illness that affects approximately seven million people worldwide. We sequenced the genome of R. prolixus, generated assembled sequences covering 95% of the genome (∼ 702 Mb), including 15,456 putative protein-coding genes, and completed comprehensive genomic analyses of this obligate blood-feeding insect. Although immune-deficiency (IMD)-mediated immune responses were observed, R. prolixus putatively lacks key components of the IMD pathway, suggesting a reorganization of the canonical immune signaling network. Although both Toll and IMD effectors controlled intestinal microbiota, neither affected Trypanosoma cruzi, the causal agent of Chagas disease, implying the existence of evasion or tolerance mechanisms. R. prolixus has experienced an extensive loss of selenoprotein genes, with its repertoire reduced to only two proteins, one of which is a selenocysteine-based glutathione peroxidase, the first found in insects. The genome contained actively transcribed, horizontally transferred genes from Wolbachia sp., which showed evidence of codon use evolution toward the insect use pattern. Comparative protein analyses revealed many lineage-specific expansions and putative gene absences in R. prolixus, including tandem expansions of genes related to chemoreception, feeding, and digestion that possibly contributed to the evolution of a blood-feeding lifestyle. The genome assembly and these associated analyses provide critical information on the physiology and evolution of this important vector species and should be instrumental for the development of innovative disease control methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,824
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle