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Enregistrement W2175973574 · doi:10.1152/ajplung.2001.281.5.l1219

Translational activation and repression by distinct elements within the 5′-UTR of ENaC α-subunit mRNA

2001· article· en· W2175973574 sur OpenAlexaff
Gail Otulakowski, Tanya Freywald, Yanxia Wen, Hugh OʼBrodovich

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPsychological repressionProtein subunitMessenger RNACell biologyFive prime untranslated regionTranslational regulationEpithelial sodium channelUntranslated regionChemistryMolecular biologyBiologyTranslation (biology)GeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rat amiloride-sensitive epithelial Na(+) channel (rENaC), the rate-limiting step in epithelial Na(+) transport, consists of three subunits, alpha, beta, and gamma. We hypothesized that alpha-rENaC translation is regulated via its 5'-untranslated region (UTR). Transient transfections of alpha-rENaC promoter-reporter constructs in representative epithelial cell lines demonstrated up to fivefold differences in activity among constructs containing different amounts of the alpha-rENaC 5'-UTR sequence. Differences in reporter protein activity did not parallel differences in reporter mRNA, demonstrating that 5'-UTR regulation must be at the level of translation. Specifically, translation was enhanced by a region extending from +53 to +211 bp downstream from the transcription start site and repressed by the region between +367 and +499 bp. Examination of the 5'-UTR sequence revealed an out-of-frame initiation codon within the repressive region, 43 bp upstream from the start of the alpha-rENaC open reading frame. Mutational analysis of this upstream start codon indicated that it plays, at most, a minor role in impeding translation both in vitro and in vivo, suggesting that additional mechanisms of translational regulation are operative.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,530

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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