Identification of cotton <i>SKP</i>1-like gene <i>GhSKP1</i> and its function in seed germination and taproot growth in tobacco
Notice bibliographique
Résumé
Hu, D-L., Chen, Q-Z., Zhang, C-J., Wang, Y., Zhang, B-J. and Tang, C-M. 2013. Identification of cotton SKP 1-like gene GhSKP1 and its function in seed germination and taproot growth in tobacco. Can. J. Plant Sci. 93: 817–825. The SKP1 (S-phase kinase-associated-protein1) protein, a key component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) ubiquitin ligase complex, has been reported to play many important roles in many organisms, including regulation of ubiquitin-mediated protein degradation, seed germination, taproot growth and auxin signaling, though no study of this gene in cotton has been performed. In this study, a SKP1 gene was isolated from upland cotton (Gossypium hirsutum L.) using the rapid amplification of cDNA ends (RACE) method and was named Gossypium hirsutum SKP1 (GhSKP1). The cDNA sequence of GhSKP1 was 813 bp containing a 474 bp open reading frame, encoding a protein of 156 amino acids with a predicted molecular weight of 17.63 kDa. The deduced amino acid of GhSKP1 had a conserved SKP1 domain. GhSKP1 expression was tested in all organs of cotton plants, and the strongest expression was observed in stamens and radicles that have actively dividing cells. Overexpression of the full-length GhSKP1 cDNA in tobacco caused delayed seed germination and shortened taproots. Our results suggest that the presence of functional conservation between GhSKP1 and SKP1 in plant developmental processes may exist.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».