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Enregistrement W2180123303 · doi:10.4141/cjps2012-312

Identification of cotton <i>SKP</i>1-like gene <i>GhSKP1</i> and its function in seed germination and taproot growth in tobacco

2013· article· en· W2180123303 sur OpenAlexvenueno aff
De-Long Hu, Quan-Zhan Chen, Chaojun Zhang, Ye Wang, Canming Tang

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch in Cotton Cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTaprootSkp1BiologyComplementary DNAGerminationF-box proteinBotanyUbiquitin ligaseGeneGeneticsUbiquitin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hu, D-L., Chen, Q-Z., Zhang, C-J., Wang, Y., Zhang, B-J. and Tang, C-M. 2013. Identification of cotton SKP 1-like gene GhSKP1 and its function in seed germination and taproot growth in tobacco. Can. J. Plant Sci. 93: 817–825. The SKP1 (S-phase kinase-associated-protein1) protein, a key component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) ubiquitin ligase complex, has been reported to play many important roles in many organisms, including regulation of ubiquitin-mediated protein degradation, seed germination, taproot growth and auxin signaling, though no study of this gene in cotton has been performed. In this study, a SKP1 gene was isolated from upland cotton (Gossypium hirsutum L.) using the rapid amplification of cDNA ends (RACE) method and was named Gossypium hirsutum SKP1 (GhSKP1). The cDNA sequence of GhSKP1 was 813 bp containing a 474 bp open reading frame, encoding a protein of 156 amino acids with a predicted molecular weight of 17.63 kDa. The deduced amino acid of GhSKP1 had a conserved SKP1 domain. GhSKP1 expression was tested in all organs of cotton plants, and the strongest expression was observed in stamens and radicles that have actively dividing cells. Overexpression of the full-length GhSKP1 cDNA in tobacco caused delayed seed germination and shortened taproots. Our results suggest that the presence of functional conservation between GhSKP1 and SKP1 in plant developmental processes may exist.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,781
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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