MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2180695179 · doi:10.1093/mollus/eyv054

Genome size estimates for Aplacophora, Polyplacophora and Scaphopoda: small solenogasters and sizeable scaphopods: Table 1.

2015· article· en· W2180695179 sur OpenAlexaff
Kevin M. Kocot, Nicholas W. Jeffery, Kelly Mulligan, Kenneth M. Halanych, T. Ryan Gregory

Notice bibliographique

RevueJournal of Molluscan Studies · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCephalopods and Marine Biology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPolyplacophoraTable (database)Evolutionary biologyGenome sizeZoologyGenomeGeneticsMolluscaGeneComputer scienceData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mollusca is the second most species-rich animal phylum and includes species with dramatically different body plans ranging from tiny, meiofaunal worms and snails to giant squid. Currently, only four well-annotated molluscan genomes have been published: the bivalves Crassostrea gigas (Zhang et al., 2012) and Pinctada fucata (Takeuchi et al., 2012), the gastropod Lottia gigantea (Simakov et al., 2013) and the cephalopod Octopus bimaculoides (Albertin et al., 2015). Additional bivalve, gastropod and cephalopod genomes are forthcoming (e.g. Moroz, 2011; Albertin et al., 2012; F. Ghiselli, personal communication; N. Whelan, personal communication). High-quality genomes from other molluscan lineages would be of great interest to the fields of malacology, comparative and evolutionary genomics, and evolutionary developmental biology. In particular, genomic data from representatives of Aculifera (Aplacophora and Polyplacophora) are of importance from an evolutionary genomics perspective, because this clade is the sister taxon of all other molluscs (Kocot, Halanych & Krug, 2011; Smith et al., 2011; Vinther et al., 2012). Likewise, Scaphopoda is interesting because it is closely related to the well-studied Gastropoda and Bivalvia, although the exact phylogenetic relationships among these three taxa remain unclear (Kocot et al., 2011; Smith et al., 2011; Vinther et al., 2012; reviewed by Kocot, 2013 and Schrödl & Stöger, 2014). Comparative developmental gene expression studies in both aculiferans and scaphopods would also be of great interest with regard to understanding the evolution of diverse molluscan body plans and complex processes such as biomineralization. Currently, these topics are only partially understood in gastropods and bivalves (e.g. Jackson, Wörheide & Degnan, 2007; Jackson et al., 2010).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,824
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Molluscan StudiesMême sujetCephalopods and Marine BiologyTravaux en français237 207