DNA barcoding of select freshwater and marine red algae (Rhodophyta)
Notice bibliographique
Résumé
T he first COI sequences from European material of Batrachospermum helminthosum and B. gelatinosum are presented and compared with equivalent data from North America. The variation between the continents was 53 bp (8%) and 10 bp (1.5%), respectively for the two species, suggesting cryptic diversity in at least the former species. Polysiphonia hemisphaerica from Norway and P. boldii from Texas differed by 8b p( 1.2%). Ah ybrid tetrasporophyte produced from ac ross between these two species revealed COI sequence identical with that of the female parent, demonstrating uniparental inheritance of mitochondria. Ptilota serrata and P. gunneri ,w hich can be difficult to distinguish morpholo- gically, were 38 bp (5.7%) different with no intraspecific variation. Sequences for as pecies temporarily labeled as P. serrata sp.1 from eastern Canada in The Barcode of Life Data Systems (BOLD), were identical with that for P. gunneri from Norway. The morphologi- cally similar species Plumaria plumosa is represented by triploid parasporangial plants and sexually reproducing plants that are geographically separated, with only the asexual phase at the northern part of the range. The two phases had COI sequences that differed by 4b p. Sequences of the invasive species Gracilaria vermiculophylla from France and the Russian Far East (Vladivostok) were identical and similar to the reported invasive haplotype from elsewhere. In addition, COI sequences obtained for Heterosiphonia japonica and Anti- thamnion hubbsii from introduced populations in Norway are presented. COI /D NA barcoding /r ed algae /s pecies identification /R hodophyta / Batrachospermum / Ptilota / Plumaria / Polysiphonia hemisphaerica / Polysiphonia boldii / Gracilaria vermiculophylla / Heterosiphonia japonica / Antithamnion hubbsii
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».