Promoter analysis of the gene encoding the β-subunit of the rat amiloride-sensitive epithelial sodium channel
Notice bibliographique
Résumé
The amiloride-sensitive epithelial Na(+) channel (ENaC), found in the apical membrane of Na(+)-absorptive epithelia, is made up of three differentially regulated subunits: alpha, beta, and gamma. We undertook a study of the 5'-end of the gene encoding the beta-ENaC subunit in the rat. 5'-Rapid amplification of cDNA ends and RNase protection assays indicated multiple transcription start sites over a 50-bp region. Sequencing 1.3 kb of the 5'-flanking DNA revealed putative binding sites for PEA3, Sp1, activator protein (AP)-1 and Oct-1 but neither a TATA box nor consensus sites for steroid hormone receptor binding. Transient transfections of reporter constructs driven by beta-ENaC 5'-flanking DNA in the representative epithelial cell lines Madin-Darby canine kidney, MLE-15, and Caco-2 revealed a negative element present between positions -424 and -311 that affected basal transcription rates. Gel shift assays showed protein-DNA binding activity of an AP-1 consensus site in this region; however, mutation of the AP-1 site did not abrogate the repressive activity of the region in transient transfections. Deletion of two clusters of Sp1 consensus binding sites between -1 and -51 bp and between -169 and -211 bp indicated that the proximal cluster was essential to basal promoter activity in transfected cell lines. In a comparison of these data with those in published studies on alpha- and gamma-ENaC promoters, the beta- and gamma-subunit promoters appear to be more similar to each other than to the alpha-promoter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».