Promoter analysis of the gene encoding the β-subunit of the rat amiloride-sensitive epithelial sodium channel
Notice bibliographique
Résumé
The amiloride-sensitive epithelial Na(+) channel (ENaC), found in the apical membrane of Na(+)-absorptive epithelia, is made up of three differentially regulated subunits: alpha, beta, and gamma. We undertook a study of the 5'-end of the gene encoding the beta-ENaC subunit in the rat. 5'-Rapid amplification of cDNA ends and RNase protection assays indicated multiple transcription start sites over a 50-bp region. Sequencing 1.3 kb of the 5'-flanking DNA revealed putative binding sites for PEA3, Sp1, activator protein (AP)-1 and Oct-1 but neither a TATA box nor consensus sites for steroid hormone receptor binding. Transient transfections of reporter constructs driven by beta-ENaC 5'-flanking DNA in the representative epithelial cell lines Madin-Darby canine kidney, MLE-15, and Caco-2 revealed a negative element present between positions -424 and -311 that affected basal transcription rates. Gel shift assays showed protein-DNA binding activity of an AP-1 consensus site in this region; however, mutation of the AP-1 site did not abrogate the repressive activity of the region in transient transfections. Deletion of two clusters of Sp1 consensus binding sites between -1 and -51 bp and between -169 and -211 bp indicated that the proximal cluster was essential to basal promoter activity in transfected cell lines. In a comparison of these data with those in published studies on alpha- and gamma-ENaC promoters, the beta- and gamma-subunit promoters appear to be more similar to each other than to the alpha-promoter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».