Notice bibliographique
Résumé
RescueMu is a modified Mu1 transposon transformed into maize to permit mutagenesis and subsequent recovery of mutant alleles by plasmid rescue. RescueMu elements insert late in the germline as well as in terminally dividing somatic (e.g., leaf) cells. Germinal insertions may result in a mutant phenotype, and RescueMu permits recovery of 5-25 kb of transposon-flanking genomic DNA without having to construct and screen genomic DNA libraries. Late somatic insertions of RescueMu do not result in a visible phenotype, but they are instead used to construct plasmid libraries of gene-enriched maize genomic DNA to facilitate the identification and sequencing of the euchromatic portion of the maize genome. This is because maize leaves contain abundant independent RescueMu somatic insertions, and 70-90% of these insertions occur preferentially into genes and not repetitive DNA. This chapter describes detailed protocols on how to obtain, generate, and use RescueMu for maize genomics, including resources developed by the Maize Gene Discovery Project (MGDP) consortium available online at ZmDB.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,082 | 0,073 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».