RESEARCH NOTE Application of a DNA barcode using the 16S rRNA gene to diagnose pest Arion species in the USA
Notice bibliographique
Résumé
Arion Ferussac, 1819, is a large, predominantly western Palearctic genus of slugs with a number of species that are of considerable agricultural and forestry concern. Many Arion species have been introduced throughout the world through commerce, and have established themselves as pests in predo- minantly synanthropic and other disturbed environments in the USA and Canada (Robinson, 1999). Since 1999, nation- wide surveys under the umbrella of the USDA North American Slug Project have been conducted to document the current distributions of non-native slug species. Arion species are as yet found to be absent from Puerto Rico, and surveys in Alaska and the Hawaiian Islands are incomplete. In view of the potential threat of new introductions of non- established Arion species, all specimens intercepted from incom- ing shipments from abroad must be identified by quarantine authorities in order to determine whether or not the associated commodity can be allowed to enter the country. Arion slugs are frequently intercepted at the US ports on commercial imports from Europe, particularly associated with shipments of mush- rooms, cut flowers, flower bulbs, horticultural plants and veg- etables. However, most intercepted slugs are immature, lacking the diagnostic genitalia that would facilitate their identifi- cation. Without internal examination, several species are difficult to identify, as the plethora of synonyms in the malaco- logical literature would suggest. The adults of some species resemble the immatures of others, and the external appearance of a species may also differ according to its geographic origin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».