"Type A" response regulators are involved in the plant-microbe interaction.
Notice bibliographique
Résumé
Plant-microbe interaction can be established as either symbiotic or pathogenic association. Regardless of any type of interaction interplayed, common strategy can be seen in the partners. Recent advances in bioinformatics and availability of abundant transcriptomics data have provided new tools for comparative analysis and achieving significant insights into underlying regulatory background of symbiosis and pathogenesis. In the present study, to find the genes which are involved in both pathogenic and symbiotic interactions, we used the microarray data pertaining bacterial interactions in M. truncatula. Those data which were publically available in NCBI analyzed using Expression Console and FlexyArray. In order to interpret gene expression patterns and investigate the relationship between co-over expressed genes, a literature survey was performed using the tools provided by Pathway Studio v9 (Elsevier). Our data analysis identified type-A response regulators (RRs) as genes that potentially respond to pathogenic and symbiotic interactions. Type-A RRs act as negative regulators of cytokinins. This study speculates that plants do not recognize bacterial pathogens from symbionts at early stage of plant-microbe interactions. Pathway analysis revealed the involvement of WUSCHEL (WUS) and SIAMES (SIM) in cross-talk between pathogen and type-A of RRs. Considering the central role of WUS and SIM in cell division, we suggest that the reduction of growth by repression of cell division is one of the adaptive responses in plants to bacterial interaction. In this way, plants try to preserve the limited energy of the mother cell and to avoid heritable damage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».