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Enregistrement W2190074293 · doi:10.3390/info6040811

Information and Phylogenetic Systematic Analysis

2015· article· en· W2190074293 sur OpenAlexafffund
Walter Craig, Jonathon Stone

Notice bibliographique

RevueInformation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueEvolution and Paleontology Studies
Établissements canadiensShared Hierarchical Academic Research Computing NetworkMcMaster UniversityFields Institute for Research in Mathematical Sciences
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMcMaster University
Mots-clésCladogramCharacter (mathematics)SynapomorphyPhylogenetic treeMeasure (data warehouse)AutapomorphyTaxonMatrix (chemical analysis)Computer scienceMathematicsCladisticsBiologyData miningPaleontologyGeneticsGeometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Information in phylogenetic systematic analysis has been conceptualized, defined, quantified, and used differently by different authors. In this paper, we start with the Shannon Uncertainty Measure information measure I, applying it to cladograms containing only consistent character states. We formulate a general expression for I, utilizing a standard format for taxon-character matrices, and investigate the effect that adding data to an existing taxon-character matrix has on I. We show that I may increase when character vectors that encode autapomorphic or synapomorphic character states are added. However, as added character vectors accumulate, I tends to a limit, which generally is less than the maximum I. We show computationally and analytically that limc→∞ I = log2 t, in which t enumerates taxa and c enumerates characters. For any particular t, upper and lower bounds in I exist. We use our observations to suggest several interpretations about the relationship between information and phylogenetic systematic analysis that have eluded previous, precise recognition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,432
Score d'incertitude au seuil0,842

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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