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Enregistrement W2194371155 · doi:10.1145/2836034.2836036

Visual analytics for supporting evidence-based interpretation of molecular cytogenomic findings

2015· article· en· W2194371155 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueData Visualization and Analytics
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésComputer scienceWorkflowVisual analyticsData scienceUsabilityAnalyticsProcess (computing)World Wide WebInterpretation (philosophy)VisualizationHuman–computer interactionData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interpreting molecular cytogenomic findings that cover the human genome (e.g., microarray results) is challenging, as it requires accessing and working with multiple, diverse sources of data that are often large and heterogeneous. These data need to be accessed, queried, and simultaneously integrated to achieve open-ended goals, such as interpreting findings to make diagnoses and engage in genetic counselling. Currently, typical workflows of users are laborious, as data sources are often not integrated and must be accessed separately. Furthermore, large document sets often have to be combed through to assist in interpretation. Analytics tools are needed to help users process and distill large bodies of information into manageable sizes so the most relevant portions can be focused on. Current tools typically do not offer support for interactively exploring and engaging with visual representations of important entities and relationships (e.g., chromosomes, gene-phenotype relationships, and scientific articles). We present VErdICT, a visual analytics tool that can support users in their interpretation of molecular cytogenomic findings. A participatory design approach was taken to make VErdICT human-centered. We describe its development, usability and usefulness, and outline some future research challenges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,903
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

En bref

Citations13
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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