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Enregistrement W2203634639 · doi:10.1139/cjz-2012-0296

First evidence of the presence of<i>NK2</i>and<i>Tlx</i>genes in bivalve molluscs

2013· article· en· W2203634639 sur OpenAlexvenueno aff
Crimgilt Mesías-Gansbiller, A. Pazos, José L. Sánchez, M. Luz Pérez‐Parallé

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgencia Española de Cooperación Internacional para el Desarrollo
Mots-clésBiologyGeneGeneticsOstrea edulisEvolutionary biologyOysterEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The NK homeobox gene cluster appears to play a primary role in the mesoderm specification and formation and nervous system development of Bilateria. NK2 class genes are transcribed in the developing gut, nervous system, and heart of insects and vertebrates. Tlx genes are involved in a variety of developmental functions such as neurone differentiation. To identify NK box genes in bivalve molluscs, we performed a polymerase chain reaction (PCR) survey with degenerate primers on genomic DNA. Three NK box sequences were identified from two bivalve species: one from the clam Venerupis pullastra (Montagu, 1803) called Vpu Tlx and two from the oyster Ostrea edulis L., 1758 called Oed Tlx and Oed Nk2. The alignment of these sequences in the UniProt database reveals a high level of conservation. Phylogenetic analyses by NJ, UPGMA, ME, MP, and ML analyses show the orthology relationships of the Tlx and Nk2 genes with other Tlx and Nk2 genes present in Metazoa genomes. This is the first report of the isolation of NK box genes in bivalve molluscs. Moreover these Tlx and Nk2 genes are the first to prove that Tlx and NK2 gene cognates exist in bivalve molluscs. The presence of these genes in Venerupis and Ostrea suggests that these genes could be conserved in bivalves in general.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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