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Enregistrement W2213975404 · doi:10.2741/4402

Exploring the characterization tools of Guanine-Quadruplexes

2015· review· en· W2213975404 sur OpenAlex
Mahima Kaushik

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in bioscience · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensInnovation Cluster (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésG-quadruplexGuanineComputational biologyTelomereUntranslated regionBiologyDNAGenomeHuman genomeGeneticsChemistryNanotechnologyCell biologyGeneRNANucleotideMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Occurrence of guanine-rich sequences throughout the genome at specific locations like chromosomal ends (telomeres), promoters and Untranslated regions (UTR's) is very well documented. Quite recently, visualization of guanine-quadruplex in human and mammalian cells have also provided a very significant evidence for the in vivo existence of guanine-quadruplex, reconfirming their biological relevance in cellular processes like replication, transcription, recombination, etc. Guanine quadruplexes have enormous potential of exhibiting various topologies which differ, by number/ orientation of strands or loop orientations etc. Some relatively new polymorphic structures like 3+1 quadruplex, G-triplex, and Tri-G-quadruplex have also been proposed for the guanine-rich sequences. Various biochemical and biophysical techniques have been used to characterize these multistranded DNA structures. An extensive review of the mechanistic models of the already existing and newly emerging techniques is actually required, which may further facilitate our understanding about these structures. This review aims to summarize some of these techniques along with their requirements and limitations, which might further give some insights for the fine tuning of the solution and environmental conditions needed for facilitating guanine-quadruplex formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle