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Enregistrement W222920292 · doi:10.1096/fasebj.23.1_supplement.978.4

Pathogenic and commensal Escherichia coli decrease ion secretion in human intestinal epithelial cells

2009· article· en· W222920292 sur OpenAlexafffund
Christina Ohland, Wallace K. MacNaughton

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCrohn's and Colitis Foundation of Canada
Mots-clésSecretionEnteropathogenic Escherichia coliMicrobiologyBiologyPathogenic Escherichia coliEscherichia coliIntiminFimbriaForskolinIn vitroEnterobacteriaceaeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

E. coli enteric bacteria consist of commensal and pathogenic strains, including enteropathogenic (EPEC) and enterohaemorrhagic (EHEC) E. coli . The genetically similar mouse pathogen Citrobacter rodentium decreases ion secretion in vivo . Our aim was to investigate how E. coli strains affect secretion in vitro . Exposure of T84 cell monolayers to EPEC or EHEC for 4 hr significantly decreased the response to the cAMP‐dependent secretagogue, forskolin, without altering Ca 2+ ‐dependent secretion as measured in Ussing chambers. EPEC mutants deficient in flagellin, bundle forming pili, Type III secretion, Tir or intimin invoked similar hyposecretory responses, indicating that these factors are not involved. Pre‐treatment with the apoptosis inhibitor Z‐VAD did not alter this effect. Lab strain (HB101) and human commensal (C1, C28/2, F18) E. coli decreased secretion to a similar extent. Heat‐killed or paraformaldehyde‐fixed EPEC, sterile culture medium or E. coli lipopolysaccharides did not cause hyposecretion. Adenylate cyclase activity is not altered by EPEC, as a cAMP assay showed no change in baseline or stimulated levels. EPEC does not alter protein levels of CFTR or NKCC1 as shown by Western blot. We conclude that pathogenic and commensal E. coli decrease cAMP‐dependent ion secretion in vitro by an unknown bacterial factor, downstream of cAMP production. Funded by III Summit Foundation & CCFC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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