[Molecular and phenotypic characterization of a VGII genotype Cryptococcus gattii XH91 isolated in China].
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To characterize the molecular and phenotypic traits of the VGII genotype of Cryptococcus gattii isolate XH91 firstly isolated in China. METHODS: The serotype was identified by molecular method; multi-locus sequence typing (MLST) was performed based on 16 gene fragments both of nuclear and mitochondria genomes; the abilities of haploid fruiting, same-sex mating and opposite sex mating were all evaluated; the phenotypic traits including melanin production, capsule size, and growth at 37 degrees C were characterized. RESULTS: The isolate XH91 firstly isolated in China was serotype B. The isolate shared the same MLST genotype with the minor outbreak genotype VGIIb from Vancouver islands. Strain XH91 could mate with the reference strain of opposite mating type and produced basidiospores, but could not mate with the reference strain of same mating type and had no ability of haploid fruiting. We did not observe obvious difference between XH91 and reference strains for melanin production, capsule size, and growth at 37 degrees C. CONCLUSION: Based on the results from MLST and phenotypic analysis, the Cryptococcus gattii strain XH91 is identical with the minor outbreak genotype VGIIb from Vancouver islands. This study will be critical to gain further insight into the emergence and molecular epidemiology of the VGII genotype of Cryptococcus gattii from China.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».