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Enregistrement W2242287470 · doi:10.1309/ajcp95qbhqwggnjp

Is “Polysomy” in Breast Carcinoma the “New Equivocal” in<i>HER2</i>Testing?

2015· editorial· en· W2242287470 sur OpenAlexaff
Paul E. Swanson, Hua Yang

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2015
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceGuidelineMedicinePolysomyMedical physicsBreast cancerMEDLINETest (biology)OncologyPathologyInternal medicineCancerFluorescence in situ hybridization

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is reasonable to assume that the ultimate purpose of evidence-based consensus guidelines in pathology practice is to improve patient care. When the American Society of Clinical Oncology and the College of American Pathologists (ASCO/CAP) convened an expert panel to consider recommendations for HER2 testing in breast cancer, the HER2 testing landscape was more a mosaic of random color and form than a coherent composition. Despite using common immunohistochemistry (IHC) and in situ hybridization (ISH) tools, each with defined interpretative criteria, diagnostic laboratories were unable to achieve levels of interlaboratory concordance that could provide a meaningful level of confidence in the reliability of HER2 test results. This lack of clear concordance was complicated by overall positive rates of up to 30% (despite an expected rate closer to 12%–16%), and this separation of actual performance from expected values reflected both unacceptably high levels of false-positive and false-negative results.1,2 The first published ASCO/CAP guideline recommendations, although perhaps a flawed redefinition of the original HER2 IHC interpretative criteria, largely reiterated interpretative guidelines created and validated for initial companion testing for trastuzumab clinical validation trials while incorporating separately approved interpretative schemes for HER2 and dual HER2 /Cep17 ISH modalities.2 The improvement in laboratory performance following release of these guidelines in 2007 was thus less likely related to interpretive guidelines than to those elements of testing that related to preanalytic factors, tissue selection, assay validation, and emphasis on reflex testing for equivocal results. Whatever the basis, substantial improvement in testing performance did occur: overall positive rates aligned more closely with expected values, false-positive and false-negative rates decreased, and concordance both between laboratories and (when comparing different testing modalities) within laboratories also improved.1 With the release of updates to these original recommendations, the ASCO/CAP panel took pains to create a testing …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,493
Écart entre enseignants0,372 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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