New insights into aphid isoprenoid pathway
Notice bibliographique
Résumé
FORM Proposal for oral presentation New insights into aphid isoprenoid pathway VANDERMOTEN Sophie, CUSSON Michel, HAUBRUGE Eric, FRANCIS Frederic 1. University of Liege, Gembloux Agro-Bio Tech, Functional and Evolutionary Entomology, Passage des Deportes 2, B-5030 Gembloux, Belgium. 2. Natural Resources Canada, Canadian Forest Service, Laurentian Forestry Centre, 1055 du PEPS, P.O. Box 10380, Stn. Ste-Foy, Quebec, QC G1V4C7, Canada. Isoprenoids form an extensive group of natural products involved in a number of important biological processes. In insects, they serve among other as hormones and pheromones. Their biosynthesis proceeds through sequential 1’-4 condensations of isopentenyl diphosphate (C5) with an allylic acceptor, the first of which is dimethylallyl diphosphate (C5). The reactions leading to the production of geranyl diphosphate (GPP; C10), farnesyl diphosphate (FPP; C15) and geranylgeranyl diphosphate (GGPP; C20), which are the precursors of mono-, sesquiand diterpenes, respectively, are catalyzed by a group of highly conserved enzymes known as short-chain isoprenyl diphosphate synthases or prenyltransferases. In recent years, the sequences of many new prenyltransferases have become available, revealing novel mechanisms of product chain-length selectivity and an intricate evolutionary path from a putative common ancestor. We characterized an aphid prenyltransferase producing both GPP and FPP in similar amounts under in vitro conditions. In an effort to identify the mechanism responsible for this dual activity, we assessed the product selectivity of several aphid prenyltransferase site-directed mutants, designed to effect substitutions in amino acid residues seen to be in close proximity to the GPP or FPP ligand in a homology model. Our analyses pointed to two amino acid residues, Gln107 and Leu110, likely to play a key role in conferring dual GPP/FPP synthase activity to the aphid enzyme. Our research is now focusing on the study of the implication of aphid GPP/FPP synthase in juvenile hormone, alarm and sexual pheromones biosynthesis using qRT-PCR and RNAi methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».