Molecular characterization and cyst-cell size relationships in the globally distributed yessotoxin producing dinoflagellate Protoceratium reticulatum
Notice bibliographique
Résumé
Preliminary results of morphological and molecular analysis of the yessotoxin producing dinoflagellate Protoceratium reticulatum (Claparède et Lachmann 1858) Bütschli 1885 are presented. Body size was measured for up to 50 specimens encountered in 34 globally distributed plankton samples. When possible, these measurements were compared to the body diameter of 50 cysts of P. reticulatum extracted from surface sediment at the same locations. The average body length of theca and average body diameter of cyst were found to be significantly correlated (R2= 0.83). A global distribution map of cyst body diameters from 609 surface sediment samples shows that the largest cysts are to be found in South Africa, Chile, British Columbia (Canada), Laptev Sea and southern Greenland. Some of these locations with large cysts coincide with locations where high cell concentrations of P. reticulatum have been recorded, in particular South Africa, Chile and British Columbia. It is therefore possible that strains forming these large cysts and cells might be responsible for toxic outbreaks of this species. We also sequenced some cysts or thecate cells germinated from cysts (LSU, SSU and ITS rDNA). This molecular data reveals that although the LSU and SSU sequences are identical for the sequenced individuals, there are significant differences in the ITS sequences of this species and currently we are reinvestigating cultures to link these molecular differences to morphological variations and toxin production. Samples from Florida and Yucatan contained Protoceratium cf. globosum and no Protoceratium reticulatum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».