Molecular cloning, characterization and expression patterns of heat shock protein 60 (HSP60) in the laying duck (<i>Anas platyrhynchos</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Wang, D., Lu, L., Tian, Y., Li, J., Shen, J., Tao, Z., Li, G. and Xu, N. 2012. Molecular cloning, characterization and expression patterns of heat shock protein 60 (HSP60) in the laying duck (Anas platyrhynchos). Can. J. Anim. Sci. 92: 425–432. In the present study, we cloned and characterized the HSP60 cDNA from Anas platyrhyncho (designated as ApHSP60) using a combination of homology and rapid amplification of cDNA ends (RACE). The full-length of ApHSP60 is 2027 bp in length, with an open reading frame of 1707 bp encoding a putative protein of 569 amino acids. Comparison of amino acid sequences of HSP60 revealed ApHSP60 is highly conserved, especially in the domains of classical HSP60 family signatures. ApHSP60 transcripts were at low expression levels throughout embryo development. ApHSP60 transcripts were constitutively expressed in all tested tissues of untreated laying duck, with a maximum level in the liver. Fluorescent real-time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction was applied to determine ApHSP60 expression after exposure to different thermal shocks. Under long term treatment with both 30°C and 35°C, ApHSP60 transcripts in heart and liver were significantly up-regulated. Otherwise, ApHSP60 transcripts were remarkably down-regulated in heart and liver under acute challenge with 40°C (a fatal temperature for laying duck). A time-dependent expression pattern of ApHSP60 was found in the recovery period after heat shock reaction. ApHSP60 expression levels in liver and heart were immediately up-regulated to the maximum at 1 h post-challenge, and then decreased to pre-challenge levels by 2 h and 3 h post-challenge, respectively. These results suggest that mRNA expression of the ApHSP60 gene is constitutive and inducible. Meanwhile, it plays an important role in response to heat stressors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».