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Enregistrement W2245685861 · doi:10.4141/cjas2012-023

Molecular cloning, characterization and expression patterns of heat shock protein 60 (HSP60) in the laying duck (<i>Anas platyrhynchos</i>)

2012· article· en· W2245685861 sur OpenAlexvenueno aff
Deqian Wang, Lizhi Lu, Yong Tian, Jinjun Li, Junda Shen, Zhengrong Tao, Guoqing Li, Ningying Xu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEarmarked Fund for China Agriculture Research System
Mots-clésComplementary DNAHeat shock proteinOpen reading frameMolecular biologyBiologyAnasMolecular cloningHSP60Amino acidRapid amplification of cDNA endsMessenger RNACloning (programming)Real-time polymerase chain reactionReverse transcription polymerase chain reactionGenePeptide sequenceBiochemistryGeneticsHsp70

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Wang, D., Lu, L., Tian, Y., Li, J., Shen, J., Tao, Z., Li, G. and Xu, N. 2012. Molecular cloning, characterization and expression patterns of heat shock protein 60 (HSP60) in the laying duck (Anas platyrhynchos). Can. J. Anim. Sci. 92: 425–432. In the present study, we cloned and characterized the HSP60 cDNA from Anas platyrhyncho (designated as ApHSP60) using a combination of homology and rapid amplification of cDNA ends (RACE). The full-length of ApHSP60 is 2027 bp in length, with an open reading frame of 1707 bp encoding a putative protein of 569 amino acids. Comparison of amino acid sequences of HSP60 revealed ApHSP60 is highly conserved, especially in the domains of classical HSP60 family signatures. ApHSP60 transcripts were at low expression levels throughout embryo development. ApHSP60 transcripts were constitutively expressed in all tested tissues of untreated laying duck, with a maximum level in the liver. Fluorescent real-time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction was applied to determine ApHSP60 expression after exposure to different thermal shocks. Under long term treatment with both 30°C and 35°C, ApHSP60 transcripts in heart and liver were significantly up-regulated. Otherwise, ApHSP60 transcripts were remarkably down-regulated in heart and liver under acute challenge with 40°C (a fatal temperature for laying duck). A time-dependent expression pattern of ApHSP60 was found in the recovery period after heat shock reaction. ApHSP60 expression levels in liver and heart were immediately up-regulated to the maximum at 1 h post-challenge, and then decreased to pre-challenge levels by 2 h and 3 h post-challenge, respectively. These results suggest that mRNA expression of the ApHSP60 gene is constitutive and inducible. Meanwhile, it plays an important role in response to heat stressors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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