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Enregistrement W224659124 · doi:10.2174/1570162x1303150506184606

The N-Terminal Region of HIV-1 Tat Protein Binds CD127 in Human CD8 T Cells to Target the Receptor for Down Regulation Through Tat's Basic Region

2015· article· en· W224659124 sur OpenAlexafffund
Scott Sugden, Paul MacPherson

Notice bibliographique

RevueCurrent HIV Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInterleukin-7 receptorJurkat cellsBiologyMolecular biologyTransfectionCell biologyCD8ImmunoprecipitationT cellReceptorCytotoxic T cellInternalizationCell cultureBiochemistryAntigenImmune systemIL-2 receptorGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously shown that soluble HIV-1 Tat protein down regulates surface expression of the interleukin (IL)-7 receptor alpha-chain (CD127) on human CD8 T cells resulting in impaired T cell proliferation and cytolytic capacity. Once taken up by CD8 T cells, Tat translocates to the inner leaflet of the plasma membrane where it interacts with the cytoplasmic tail of CD127 inducing receptor internalization and degradation by the proteasome. Here we characterized the regions of Tat required to interact with CD127 and induce receptor down regulation from the cell surface. To do this, a series of histidine-tagged Tat deletion mutants were generated and expressed as purified soluble protein, or cloned into a DNA expression vector and transfected into primary human CD8 T cells and a CD127 expressing Jurkat cell line. Protein-protein interactions were assessed by co-immunoprecipitation. Substitution of the first 10 Nterminal residues or deletion of residues 17-21 prevented Tat from interacting with and down regulating CD127 from the cell surface. Deletion of the basic region also prevented Tat from down regulating CD127 but did not prevent Tat from binding to the receptor. Notably, an endogenously expressed Tat variant lacking the basic region caused an accumulation of CD127 at the cell surface. We propose a model where Tat interacts with CD127 via its N-terminal region and recruits cellular factors via its basic region to down regulate CD127 from the cell surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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