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Enregistrement W2253947615 · doi:10.1128/iai.00843-15

Uncovering an Important Role for YopJ in the Inhibition of Caspase-1 in Activated Macrophages and Promoting Yersinia pseudotuberculosis Virulence

2016· article· en· W2253947615 sur OpenAlexaff
Taylor J. Schoberle, Lawton K. Chung, Joseph B. McPhee, Ben Bogin, James B. Bliska

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYersinia bacterium, plague, ectoparasites research
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésYersinia pseudotuberculosisBiologyMicrobiologyEffectorYersiniaYersinia pestisMutantType three secretion systemInflammasomeInnate immune systemSecretionVirulenceCell biologyImmune systemInflammationBacteriaImmunologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic Yersinia species utilize a type III secretion system to translocate Yop effectors into infected host cells. Yop effectors inhibit innate immune responses in infected macrophages to promote Yersinia pathogenesis. In turn,Yersinia-infected macrophages respond to translocation of Yops by activating caspase-1, but different mechanisms of caspase-1 activation occur, depending on the bacterial genotype and the state of phagocyte activation. In macrophages activated with lipopolysaccharide (LPS) prior to Yersinia pseudotuberculosis infection, caspase-1 is activated by a rapid inflammasome-dependent mechanism that is inhibited by translocated YopM. The possibility that other effectors cooperate with YopM to inhibit caspase-1 activation in LPS-activated macrophages has not been investigated. Toward this aim, epistasis analysis was carried out in which the phenotype of aY. pseudotuberculosis yopM mutant was compared to that of a yopJ yopM, yopE yopM, yopH yopM, yopT yopM, or ypkA yopM mutant. Activation of caspase-1 was measured by cleavage of the enzyme, release of interleukin-1β (IL-1β), and pyroptosis in LPS-activated macrophages infected with wild-type or mutant Y. pseudotuberculosis strains. Results show enhanced activation of caspase-1 after infection with the yopJ yopM mutant relative to infection by any other single or double mutant. Similar results were obtained with the yopJ, yopM, and yopJ yopM mutants ofY ersinia pestis Following intravenous infection of mice, theY. pseudotuberculosis yopJ mutant was as virulent as the wild type, while the yopJ yopM mutant was significantly more attenuated than the yopM mutant. In summary, through epistasis analysis this work uncovered an important role for YopJ in inhibiting caspase-1 in activated macrophages and in promoting Yersinia virulence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,211
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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