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Enregistrement W2256846930 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.934.17

FRET assessment of CFTR molecular assembly

2008· article· en· W2256846930 sur OpenAlexaff
Bakhrom K. Berdiev, Albert Tousson, Henderika M.J. Oosterveld‐Hut, Yawar J. Qadri, Estelle Cormet‐Boyaka, Jeong S. Hong, Cathy M. Fuller, Eric J. Sorscher, Gergely L. Lukács, Dale Benos

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésFörster resonance energy transferChemistryYellow fluorescent proteinBiophysicsFluorescence recovery after photobleachingFluorescenceCytoplasmMolecular biologyBiochemistryBiologyGeneMembranePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In spite of extensive studies, uncertainty exists regarding the number of CFTR molecules that come together to form a conducting pore. At present, findings point both to monomeric and multimeric assembly of CFTR protein. We evaluated the CFTR assembly by fluorescence resonance energy transfer imaging. FRET exploits the exquisite sensitivity of fluorescence measurements to detect molecular complexes with near angstrom resolution. We assayed for FRET between (i) N‐terminally tagged CFTRs (ECFP‐CFTR and EYFP‐CFTR); (ii) C‐terminally tagged CFTRs (CFTR‐ECFP and CFTR‐EYFP); and (iii) both N‐terminally and C‐terminally tagged CFTRs (ECFP‐CFTR and CFTR‐EYFP). We found no appreciable increase in CFP fluorescence after selective photobleaching of YFP, indicative of no FRET occurrence. Our findings show that the cytoplasmic tails of CFTR are not in sufficient proximity for the occurrence of FRET, suggestive of monomeric organization of CFTR. Supported by NIH 2RO1‐DK37206‐15, NIH P50 DK53090‐05, NIH RO1‐ DK075302 , CFF/CFFT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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