Notice bibliographique
Résumé
R-GECO1 is a red-shifted calcium indicator (Zhao et al. 2011). Besides being suitable for monitoring the activity of identified GFP-labeled neurons, it could also be useful for optogenetic neural circuit mapping where Chr2 expressing neurons can be activated using blue-light. To apply this new tool in <em>Drosophila</em> neurobiology we have made a UAS-R-GECO1 transgenic stock so that R-GECO1 can be expressed in many different parts of its nervous system using the Gal4/UAS system (Brand and Perrimon 1993). <strong>A.</strong> The coding sequence of R-GECO1 was first PCR amplified from the CMV-R-GECO1 plasmid (donated by Robert Campbell, Univ. of Alberta, Edmonton, Canada) using the following oligos:1.FWD: 5'-GAGAGGTACCAATCAAAATGGTCGACTCTTCACGTCGTAAGTG-3' and REV: 5'-GAGAGGATCCTACTTCGCTGTCATCATTTGTACAAAC-3'. This PCR product [KpnI-AATCAAA-R-GECO-BamHI, ~1.2 kb] was digested with KpnI + BamHI restriction enzymes and subcloned into the KpnI & BamHI sites of the pJFRC14-MCS-attB vector (modified from Pfeiffer et al. 2010). This transgene was targeted for insertion into the <em>Drosophila</em> second chromosome (attP40 site) using the PhiC31 integrase (microinjection by BestGene Inc.). <strong>B. </strong>The expression of R-GECO1 in the larval CNS (middle panel). Flies containing the UAS-R-GECO1 transgene were crossed to the Cha-Gal4, UAS-GFP recombinant line. The CNS of progeny larvae were visualized using an epifluoresence microscope with appropriate optical filter settings. Arrows indicate fluorescence in cell bodies. Br: Brain, VC: ventral cord. <strong>References:</strong> 1. Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes. Brand AH, Perrimon N. Development. 1993:401-15. PMID: 8223268 2. Refinement of tools for targeted gene expression in <em>Drosophila</em>. Pfeiffer BD, Ngo TT, Hibbard KL, Murphy C, Jenett A, Truman JW, Rubin GM. Genetics. 2010.186:735-55. PMID: 20697123 3. An expanded palette of genetically encoded Ca²⁺ indicators. Zhao Y, Araki S, Wu J, Teramoto T, Chang YF, Nakano M, Abdelfattah AS, Fujiwara M, Ishihara T, Nagai T, Campbell RE. Science. 2011.1888-91. PMID: 21903779 <strong>Acknowledgements: </strong>Many thanks to the Macleod lab (University of Texas Health Science Center at San Antonio, USA) and the Louis Lab (CRG, Barcelona, Spain) for the excellent support and discussions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».