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Enregistrement W2259804540 · doi:10.1038/ncomms10156

The experimental power of FR900359 to study Gq-regulated biological processes

2015· article· en· W2259804540 sur OpenAlexaff
Ramona Schrage, Anna-Lena Schmitz, Evelyn Gaffal, Suvi Annala, Stefan Kehraus, Daniela Wenzel, Katrin M. Büllesbach, Tobias Bald, Asuka Inoue, Yuji Shinjo, Ségolène Galandrin, Naveen Shridhar, Michael Hesse, Manuel Grundmann, Nicole Merten, Thomas H. Charpentier, Matthew Martz, Adrian J. Butcher, Tanja Slodczyk, Sylvain Armando, Maike Effern, Yoon Namkung, Laura Jenkins, Velten Horn, Anne Stößel, Harald Dargatz, Daniel Tietze, Diana Imhof, Céline Galès, Christel Drewke, Christa E. Müller, Michael Hölzel, Graeme Milligan, Andrew B. Tobin, Jesús Gomeza, Henrik Dohlman, John Sondek, T. Kendall Harden, Michel Bouvier, Stéphane A. Laporte, Junken Aoki, Bernd K. Fleischmann, Klaus Mohr, Gabriele M. König, Thomas Tüting, Evi Kostenis

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensInstitute for Research in Immunology and CancerUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyCore Research for Evolutional Science and TechnologyDivision of Materials ResearchNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilUniversità degli Studi di FerraraDeutsche ForschungsgemeinschaftJapan Agency for Medical Research and DevelopmentBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilStrategiske Forskningsråd
Mots-clésHeterotrimeric G proteinPertussis toxinGene isoformG proteinGs alpha subunitCell biologyG protein-coupled receptorChemistryBiologyComputational biologySignal transductionBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the discovery of heterotrimeric αβγ G proteins ∼25 years ago, their selective perturbation by cell-permeable inhibitors remains a fundamental challenge. Here we report that the plant-derived depsipeptide FR900359 (FR) is ideally suited to this task. Using a multifaceted approach we systematically characterize FR as a selective inhibitor of Gq/11/14 over all other mammalian Gα isoforms and elaborate its molecular mechanism of action. We also use FR to investigate whether inhibition of Gq proteins is an effective post-receptor strategy to target oncogenic signalling, using melanoma as a model system. FR suppresses many of the hallmark features that are central to the malignancy of melanoma cells, thereby providing new opportunities for therapeutic intervention. Just as pertussis toxin is used extensively to probe and inhibit the signalling of Gi/o proteins, we anticipate that FR will at least be its equivalent for investigating the biological relevance of Gq.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations372
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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