MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2261214933

Regulation of Systemic Acquired Resistance through the Interaction of Arabidopsis thaliana Transcription factors TGAI and TGA2 with NPRI

2012· article· en· W2261214933 sur OpenAlexfundno aff
Amanda Rochon

Notice bibliographique

RevueBrock University Digital Repository (Brock University) · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Innovation Trust
Mots-clésArabidopsisSystemic acquired resistanceTransactivationTranscription factorBiologyTranscription (linguistics)GeneGeneticsRepressorCell biologyComputational biologyMutant
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arabidopsis thaliana is an established model plant system for studying plantpathogen
\ninteractions. The knowledge garnered from examining the mechanism of
\ninduced disease resistance in this model system can be applied to eliminate the cost and
\ndanger associated with current means of crop protection.
\nA specific defense pathway, known as systemic acquired resistance (SAR),
\ninvolves whole plant protection from a wide variety of bacterial, viral and fungal
\npathogens and remains induced weeks to months after being triggered. The ability of
\nArabidopsis to mount SAR depends on the accumulation of salicylic acid (SA), the NPRI
\n(non-expressor of pathogenesis related gene 1) protein and the expression of a subset of
\npathogenesis related (PR) genes. NPRI exerts its effect in this pathway through
\ninteraction with a closely related class of bZIP transcription factors known as TGA
\nfactors, which are named for their recognition of the cognate DNA motif TGACG.
\nWe have discovered that one of these transcription factors, TGA2, behaves as a
\nrepressor in unchallenged Arabidopsis and acts to repress NPRI-dependent activation of
\nPRJ. TGA1, which bears moderate sequence similarity to TGA2, acts as a transcriptional
\nactivator in unchallenged Arabidopsis, however the significance of this activity is
\nJ
\nunclear. Once SAR has been induced, TGAI and TGA2 interact with NPRI to form
\ncomplexes that are capable of activating transcription. Curiously, although TGAI is
\ncapable of transactivating, the ability of the TGAI-NPRI complex to activate
\ntranscription results from a novel transactivation domain in NPRI. This transactivation
\ndomain, which depends on the oxidation of cysteines 521 and 529, is also responsible for
\nthe transactivation ability of the TGA2-NPRI complex. Although the exact mechanism preventing TGA2-NPRI interaction in
\nunchallenged Arabidopsis is unclear, the regulation of TGAI-NPRI interaction is based
\non the redox status of cysteines 260 and 266 in TGAl. We determined that a
\nglutaredoxin, which is an enzyme capable of regulating a protein's redox status, interacts
\nwith the reduced form of TGAI and this interaction results .in the glutathionylation of
\nTGAI and a loss of interaction with NPRl.
\nTaken together, these results expand our understanding of how TGA transcription
\nfactors and NPRI behave to regulate events and gene expression during SAR.
\nFurthermore, the regulation of the behavior of both TGAI and NPRI by their redox
\nstatus and the involvement of a glutaredoxin in modulating TGAI-NPRI interaction
\nsuggests the redox regulation of proteins is a general mechanism implemented in SAR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,855
Score d'incertitude au seuil0,278

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,178
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrock University Digital Repository (Brock University)Même sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207