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Enregistrement W2262877696 · doi:10.82308/33206

Characterization of a family of yeast transcriptional regulators : the zine cluster proteins

2003· dissertation· en· W2262877696 sur OpenAlexfundno aff
Bassel Akache

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2003
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilTakeda OncologyMedical Research Council CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyGeneGeneticsSaccharomyces cerevisiaeMultiple drug resistanceGene clusterZinc fingerTranscriptional regulationGenomeCell biologyComputational biologyGene expressionTranscription factorDrug resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the zinc cluster (or binuclear cluster) protein family are characterized by a Zn(II)Cys6 zinc finger involved in DNA recognition and binding. These fungal proteins are transcriptional regulators of genes involved in a wide variety of cellular processes. One member, Gal4p, is involved in galactose metabolism, while others play a major role in primary and secondary metabolism, control of meiosis, and multidrug resistance. Sequencing of the Saccharomyces cerevisiae genome has revealed that 55 genes encoding putative zinc cluster proteins are present in budding yeast. However, the roles of many of these zinc cluster proteins are unknown. In order to better understand their functions, we have performed a phenotypic analysis of these putative zinc cluster proteins. We have implicated a number of them in a variety of processes in the cell, including multidrug resistance. Stb5p has been shown to be a major player in regulating the expression of multidrug resistance genes. Other zinc cluster activators of multidrug resistance genes include Pdr1p, Pdr3p, and Yrr1p. These regulators of multidrug resistance appear to interact with each other, forming many different sub-populations of homo- and heterodimers. Stb5p is found predominantly as a heterodimer with Pdr1p. It also appears that Pdr1p is a master regulator able to interact with many different partners, enabling it to mediate control over multidrug resistance genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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