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Enregistrement W2262913519 · doi:10.1093/jac/dkv211

Induced tigecycline resistance in<i>Streptococcus pneumoniae</i>mutants reveals mutations in ribosomal proteins and rRNA

2015· article· en· W2262913519 sur OpenAlexafffund
Andréanne Lupien, Hélène Gingras, Philippe Leprohon, Marc Ouellette

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésTigecyclineBiologyMicrobiologyMutantEffluxRibosomal RNAStreptococcus pneumoniaeTetracyclineGeneticsGeneAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Tigecycline is a broad-spectrum antibiotic acting at the level of the 30S ribosomal subunit to inhibit translation. While Streptococcus pneumoniae remains susceptible to tigecycline, resistance is beginning to emerge in some species and mainly involves efflux or mutations in ribosome constituents. We describe here the characterization of S. pneumoniae mutants selected for resistance to tigecycline. METHODS: Molecular determinants of resistance to tigecycline in S. pneumoniae were studied through WGS of two series of mutants made resistant to tigecycline in vitro in a stepwise fashion and by reconstructing tigecycline resistance using DNA transformation. RESULTS: The tigecycline-resistant S. pneumoniae M1TGC-6 and M2TGC-6 mutants were cross-resistant to tetracycline and minocycline. A role in tigecycline resistance could be attributed to 4 of the 12 genes that were mutated in both mutants. Mutations in ribosomal proteins S10 and S3, acquired early and late during selection, respectively, were implicated in resistance in both mutants. Similarly, mutations were detected in the four alleles of the 16S ribosomal RNA at sites involved in tigecycline binding and the number of mutated alleles correlated with the level of resistance. Finally, the gene spr1784 encodes an RsmD-like 16S rRNA methyltransferase for which inactivating mutations selected in the S. pneumoniae tigecycline-resistant mutants were found to decrease susceptibility to tigecycline. CONCLUSIONS: This first report about tigecycline resistance mechanisms in S. pneumoniae revealed that, in contrast to Gram-negative species, for which efflux appears central for tigecycline resistance, resistance in the pneumococcus occurs through mutations related to ribosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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