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Enregistrement W2263381938 · doi:10.1021/acs.biochem.5b01140

Biochemical Comparison of Tpm1.1 (α) and Tpm2.2 (β) Tropomyosins from Rabbit Skeletal Muscle

2016· article· en· W2263381938 sur OpenAlexaff
Elke M. Lohmeier‐Vogel, David H. Heeley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTropomyosinActinSkeletal muscleMyosinChemistryBiochemistryBiophysicsSalt bridgeBiologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tpm1.1 (α) and Tpm2.2 (β) tropomyosins (39 amino acid substitutions) were isolated from adult rabbit skeletal muscle without chemical modification of cysteine, with negligible phosphorylation as assessed by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, and characterized biochemically. Reconstituted skeletal thin filaments composed of Tpm2.2 produce ∼30% less Ca(II)-induced activation of the steady-state actomyosin-S1MgATPase rate than Tpm1.1 does. This is observed at a high S1/actin ratio (6 μM myosin-S1A1, 3 μM thin filaments, pCa 4) and as a function of pCa (0.3 μM myosin-S1A1, 25 μM thin filaments). The two pCa versus MgATPase relationships are similar in terms of their steepness and midpoint. Isotype has a bearing on self-polymerization and interaction with troponin. Solutions (pH 7, ionic strength of ∼30 mM) of Tpm2.2 are more viscous than solutions of Tpm1.1, an observation explained by substitutions at the carboxy-terminal end of the molecule, including His276Asn and Met281Ile. Conversely, the enhancement of viscosity of Tpm1.1 by skeletal troponin is greater than that for Tpm2.2. Further, Tpm1.1 binds more strongly than Tpm2.2 to skeletal troponin-Sepharose, as evidenced by a later elution position in the salt gradient. Mixtures of tropomyosin and the amino-terminal CNBr fragment of troponin-T, CB1 (residues 1-151), were chromatographed on a size exclusion column in the presence of different concentrations of KCl. In 0.1 M salt, CB1 co-elutes with either isoform but is largely dissociated at 0.22 M. At intermediate salt concentrations, different degrees of complexation are observed, more extensive for Tpm1.1 than for Tpm2.2. Thus, the first reported variants of tropomyosin are distinct in their interactive and functional properties. The biochemical properties of Tpm2.2 are of particular relevance to the immature skeletal muscle thin filament.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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