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Enregistrement W2266026172 · doi:10.1002/ajmg.a.37428

Three new cases of terminal deletion of the long arm of chromosome 7 and literature review to correlate genotype and phenotype manifestations

2016· review· en· W2266026172 sur OpenAlexafffund
Seemi Ayub, Macoura Gadji, Kada Krabchi, Sylvie Côté, Jean Gekas, Bruno Maranda, Régen Drouin

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversity of ManitobaCancerCare ManitobaUniversité du Québec à MontréalUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesMichigan State PoliceCanada Research ChairsLeukemia and Lymphoma Society of CanadaManitoba Health Research Council
Mots-clésTerminal (telecommunication)Long armPhenotypeGeneticsGenotypeChromosomeBiologyGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Partial monosomy of the long arm of chromosome 7 has been characterized by wide phenotypic manifestations, but holoprosencephaly (HPE) and sacral agenesis have frequently been associated with this chromosomal deletion. A clear relationship between genotype and phenotype remains to be defined in the 7q deletion syndrome. Three patients (1, 2, and 3) were investigated with 7q terminal deletion and compared with similar deletion cases in the literature in order to stratify the phenotypes associated with 7q35 and 7q36 terminal deletion patients. Patients 1, 2, and 3 were carrying a de novo terminal deletion at bands 7q36.2, 7q35, and 7q36.1, respectively. In patient 3, a small Xq28 duplication was also identified by array-CGH. Our patients presented with heterogeneous phenotypic manifestations, which could imply the possible role of environmental factors (multifactorial inheritance), structural variations in the non-coding regions, penetrance, and/or polymorphism. The varying length of deletion was also taken into account. Growth retardation was the most frequent symptom found in both 7q35 and 7q36 patients we reviewed. The occurrence of HPE and sacral malformation together was seen in less than 10% of the reviewed cases in both kinds of deletion. HPE was associated mainly in cases with an unbalanced translocation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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