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Enregistrement W2268001801 · doi:10.1038/ncomms10494

Genome-wide meta-analysis uncovers novel loci influencing circulating leptin levels

2016· article· en· W2268001801 sur OpenAlex
Tuomas O. Kilpeläinen, Jayne F. Martin Carli, Alicja A. Skowronski, Qi Sun, Jennifer Kriebel, Mary F. Feitosa, Åsa K. Hedman, Alexander Drong, James E. Hayes, Jinghua Zhao, Tune H. Pers, Ursula M. Schick, Niels Grarup, Zoltán Kutalik, Stella Trompet, Massimo Mangino, Kati Kristiansson, Marian Beekman, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Joel Eriksson, Peter Henneman, Jari Lahti, Toshiko Tanaka, Jian’an Luan, Fabiola Del Greco M, Dorota Pasko, Frida Renström, Sara M. Willems, Anubha Mahajan, Lynda M. Rose, Xiuqing Guo, Ching‐Ti Liu, Marcus E. Kleber, Louis Përusse, Tom R. Gaunt, Tarunveer S. Ahluwalia, Y.F. Ramos, Najaf Amin, Antoinette Amuzu, Inês Barroso, Claire Bellis, John Blangero, Brendan M. Buckley, Stefan Böhringer, Yii‐Der I. Chen, Anton J. N. de Craen, David R. Crosslin, Caroline Dale, Zari Dastani, Felix R. Day, Joris Deelen, Graciela E. Delgado, Ayşe Demirkan, Francis Finucane, Ian Ford, Melissa E. Garcia, Christian Gieger, Stefan Gustafsson, Göran Hallmans, Susan E. Hankinson, Aki S. Havulinna, Christian Herder, Dena Hernandez, Andrew A. Hicks, David J. Hunter, Thomas Illig, Erik Ingelsson, Andreea Ioan‐Facsinay, John‐Olov Jansson, Nancy S. Jenny, Marit E. Jørgensen, Torben Jørgensen, Magnus K. Karlsson, Wolfgang Köenig, Peter Kraft, Joanneke C. Kwekkeboom, Tiina Laatikainen, Karl‐Heinz Ladwig, Charles A. LeDuc, Gordon Lowe, Yingchang Lu, Pedro Marques‐Vidal, Christa Meisinger, Cristina Menni, Andrew P. Morris, Richard H. Myers, Satu Männistö, Mike A. Nalls, Lavinia Paternoster, Annette Peters, Aruna D. Pradhan, Tuomo Rankinen, Laura J. Rasmussen‐Torvik, Wolfgang Rathmann, Treva Rice, J. Brent Richards, Paul M. Ridker, Naveed Sattar, David B. Savage, Stefan Söderberg, Nicholas J. Timpson, Liesbeth Vandenput, Hae‐Won Uh, Marie‐Claude Vohl, Mark Walker, Heinz‐Erich Wichmann, Elisabeth Widén, Andrew R. Wood, Jie Yao, Tanja Zeller, Yiying Zhang, Ingrid Meulenbelt, M. Kloppenburg, Arne Astrup, Thorkild I. A. Sørensen, Mark A. Sarzynski, D. C. Rao, Pekka Jousilahti, Erkki Vartiainen, Albert Hofman, Fernando Rivadeneira, André G. Uitterlinden, Eero Kajantie, Clive Osmond, Aarno Palotie, Johan G. Eriksson, Markku Heliövaara, Paul Knekt, Seppo Koskinen, Antti Jula, Markus Perola, Risto Huupponen, Jorma Viikari, Mika Kähönen, Terho Lehtimäki, Olli T. Raitakari, Dan Mellström, Mattias Lorentzon, Juan P. Casas, Winfried März, Aaron Isaacs, Ko Willems van Dijk, Cornelia M. van Duijn, Tamara B. Harris, Claude Bouchard, Matthew Allison, Daniel I. Chasman, Claes Ohlsson, Lars Lind, Robert A. Scott, Claudia Langenberg, Nicholas J. Wareham, Luigi Ferrucci, Timothy M. Frayling, Peter P. Pramstaller, Ingrid B. Borecki, Dawn Waterworth, Sven Bergmann, Gérard Waeber, Péter Vollenweider, Henrik Vestergaard, Torben Hansen, Oluf Pedersen, Frank B. Hu, P. Eline Slagboom, Harald Grallert, Tim D. Spector, J. Wouter Jukema, Robert J. Klein, Erik E Schadt, Paul W. Franks, Cecilia M. Lindgren, Rudolph L. Leibel, Ruth J. F. Loos

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreUniversité LavalInstitut National d'Optique
Organismes subventionnairesFP7 Ideas: European Research CouncilNational Center for Research ResourcesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingMedical Research CouncilU.S. Public Health ServiceNational Institutes of HealthProvincia autonoma di Bolzano - Alto AdigeEuropean Regional Development FundDutch Arthritis AssociationKing's College LondonAcademy of FinlandTerveyden ja hyvinvoinnin laitosH. Lundbeck A/SNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesKnut och Alice Wallenbergs StiftelseTurun Yliopistollinen KeskussairaalaAmgenChinese Society of Clinical OncologyNovo Nordisk FondenOrionin TutkimussäätiöEmil Aaltosen SäätiöAugustinus FondenNational Human Genome Research InstituteDanmarks Frie ForskningsfondNational Institute for Health and Care ResearchLastentautien TutkimussäätiöDiabetesforeningenVetenskapsrådetDonald W. Reynolds FoundationHersenstichtingGlaxoSmithKlineSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöJuho Vainion SäätiöPaavo Nurmen SäätiöLi Ka Shing FoundationCentre for Medical Systems BiologyNovo NordiskHjärt-LungfondenNational Cancer InstituteLundbeckfondenSuomen KulttuurirahastoStiftelsen för Strategisk ForskningSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversiteit LeidenBristol-Myers SquibbUmeå UniversitetNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchDiabetes UKBritish Heart FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungTampereen TuberkuloosisäätiöKelaMinistero della SalutePfizerNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustNational Center for Advancing Translational SciencesHjerteforeningenNational Science Foundation
Mots-clésGenomeLeptinBiologyGeneticsMeta-analysisComputational biologyGeneMedicineObesityInternal medicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leptin is an adipocyte-secreted hormone, the circulating levels of which correlate closely with overall adiposity. Although rare mutations in the leptin (LEP) gene are well known to cause leptin deficiency and severe obesity, no common loci regulating circulating leptin levels have been uncovered. Therefore, we performed a genome-wide association study (GWAS) of circulating leptin levels from 32,161 individuals and followed up loci reaching P<10(-6) in 19,979 additional individuals. We identify five loci robustly associated (P<5 × 10(-8)) with leptin levels in/near LEP, SLC32A1, GCKR, CCNL1 and FTO. Although the association of the FTO obesity locus with leptin levels is abolished by adjustment for BMI, associations of the four other loci are independent of adiposity. The GCKR locus was found associated with multiple metabolic traits in previous GWAS and the CCNL1 locus with birth weight. Knockdown experiments in mouse adipose tissue explants show convincing evidence for adipogenin, a regulator of adipocyte differentiation, as the novel causal gene in the SLC32A1 locus influencing leptin levels. Our findings provide novel insights into the regulation of leptin production by adipose tissue and open new avenues for examining the influence of variation in leptin levels on adiposity and metabolic health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,753
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle