Group II Intron-Mediated<i>Trans</i>-Splicing in the Gene-Rich Mitochondrial Genome of an Enigmatic Eukaryote,<i>Diphylleia rotans</i>
Notice bibliographique
Résumé
Although mitochondria have evolved from a single endosymbiotic event, present day mitochondria of diverse eukaryotes display a great range of genome structures, content and features. Group I and group II introns are two features that are distributed broadly but patchily in mitochondrial genomes across branches of the tree of eukaryotes. While group I intron-mediated trans-splicing has been reported from some lineages distantly related to each other, findings of group II intron-mediated trans-splicing has been restricted to members of the Chloroplastida. In this study, we found the mitochondrial genome of the unicellular eukaryote Diphylleia rotans possesses currently the second largest gene repertoire. On the basis of a probable phylogenetic position of Diphylleia, which is located within Amorphea, current mosaic gene distribution in Amorphea must invoke parallel gene losses from mitochondrial genomes during evolution. Most notably, although the cytochrome c oxidase subunit (cox) 1 gene was split into four pieces which located at a distance to each other, we confirmed that a single mature mRNA that covered the entire coding region could be generated by group II intron-mediated trans-splicing. This is the first example of group II intron-mediated trans-splicing outside Chloroplastida. Similar trans-splicing mechanisms likely work for bipartitely split cox2 and nad3 genes to generate single mature mRNAs. We finally discuss origin and evolution of this type of trans-splicing in D. rotans as well as in eukaryotes.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».