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Enregistrement W2273910505 · doi:10.1096/fasebj.22.2_supplement.263

YJL185c encodes a peroxisomal protein that binds Inp1p and is required for peroxisome retention

2008· article· en· W2273910505 sur OpenAlexaff
Monica Fagarasanu, Fred D. Mast, Richard A. Rachubinski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeroxisomeOrganelleCell biologySaccharomyces cerevisiaeBiologyProtein targetingCell divisionCompartmentalization (fire protection)Green fluorescent proteinYeastBiochemistryGeneCellMembrane proteinEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The inheritance of cellular organelles from mother cell to daughter cell is critical for eukaryotic cells to maintain the metabolic benefits of compartmentalization. Because of its asymetrical division, the budding yeast Saccharomyces cerevisiae has been used extensively to understand the molecular pathways involved in the inheritance of different organelles. The inheritance of peroxisomes is dependent on the peroxisomal protein Inp1p, which is directly involved in tethering peroxisomes to anchoring structures at the cell cortex. Although Inp1p is a major factor acting in the peroxisomal retention pathway, we proposed that its action in peroxisome retention is regulated by additional proteins. with which it interacts. A protein of unknown function encoded by the open reading frame YJL185c was shown to interact with Inp1p by the yeast two‐hybrid system. Cells deleted for YJL185c exhibit an altered peroxisome morphology and a preferred localization of peroxisomes to the bud neck. Yjl185p tagged with green fluorescent protein, GFP, shows both a peroxisomal and a weak cortical localization. Our studies help to clarify the mechanism of action of Inp1p in peroxisome inheritance and identify Yjl185p as a novel protein involved in peroxisome inheritance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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