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Enregistrement W2276148750 · doi:10.1136/jmedgenet-2015-103577.2

MG-106 Global developmental delay and characteristic facial features associated with pacs1 gene mutation – report of two cases

2015· article· en· W2276148750 sur OpenAlexaff
Lauren Chad, Brian HY Chung, Christian R. Marshall, Daniele Merico, Riyana Babul‐Hirji, Dimitrios J. Stavropoulos, David Chitayat

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMount Sinai HospitalSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypertelorismExome sequencingImperforate anusMedicineFrontal BossingGeneticsAnatomyMutationPediatricsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intellectual disability (ID) affects 1%–3% of the population. While it has a strong genetic component, finding a genetic diagnosis remains challenging. Given the high rate of de novo events in ID, family-based sequencing may be an important tool. In 2012 Schuurs-Hoeijmakers et al., reported two children with ID and characteristic features associated with a heterozygote mutation in PACS1. We report the same mutation elucidated by whole exome sequencing (WES) in two additional children. Patient 1 was born at term to a 30-year-old primigravida from Bangladesh. Her birth weight and length were 3–10th% and head circumference 50–75th%. ID presented in the first year of life. She had sparse hair, a high forehead, frontal bossing, hypertelorism, deep-set eyes, a broad nasal root, full lips and a wide mouth. She had marked hypotonia, decreased muscle bulk and hyperextensible joints. WES revealed a PACS1 mutation. (NM_018026)exon4:c. C607T:p. R203W. Patient 2 was born at term to a 34-year-old primigravida from China. Birth weight and length were 10–25th% and head circumference 25–50th%. At birth, an anoplasty was performed for an ectopic anus. A right duplex kidney and undescended testes were identified. ID presented before age one. He had a short forehead, bushy eyebrows, short nose, large mouth, uplifting earlobes, bilateral single palmar creases, widely spaced nipples and an umbilical hernia. WES revealed the same mutation. Our two cases highlight the clinical utility of WES in helping establish a diagnosis of an unfamiliar clinical syndrome and supports the discovery of a now recognisable syndrome due to mutation in PACS1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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