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Enregistrement W2276239040 · doi:10.14288/1.0092660

Assessing exposure to Cryptococcus gattii

2010· article· en· W2276239040 sur OpenAlexaboutno aff
Andrea Griffiths

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCryptococcus gattiiCryptococcosisCryptococcusBiologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cryptococcus gattii is an encapsulated basidomycetous yeast that is capable of causing cryptococcosis in humans and animals. The disease caused by C. gattii frequently begins with pneumonia which in some cases can disseminate into fatal form of meningitis. Traditionally, this organism was thought to occur globally in tropical and subtropical regions, however recently it has been isolated from the Coastal Douglas Fir Zone on Vancouver Island, British Columbia (BC), a coastal temperate zone. From 1999 to present, there have been more than 130 human cases of Cryptococcosis caused by C. gattii on Vancouver Island and numerous cases in companion animals and wildlife. The aim of this study was to develop an assay to identify biomarkers of exposure to C. gattii which could be used to determine the extent of exposure of residents of BC. A Western blot analysis was developed to identify cytoplasmic antigens isolated from C. gattii which are recognized by antibodies in test sera. The sera of 77 Vancouver Island residents were tested following the 1999 outbreak of C. gattii and greater than 80% of those tested (at a 1 in 250 dilution of serum) were found to have antibodies against cytoplasmic antigens unique to the organism. Conversely, at the same dilution only 25% of those tested (n=51) from other areas of BC, the Yukon and Northwest Territories prior to the 1999 outbreak had antibodies against C. gattii antigens. The most commonly recognized antigens were 20 kDa and 50 kDa in size and their identity is presently unknown. This Western blot analysis has proven to be a useful means of suggesting potential biomarkers of exposure to C. gattii in a population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil0,183

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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